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Hacking the ribosome to map virus-host associations

Descrizione del progetto

L’«hacking del ribosoma» per lo sviluppo di strumenti universali di mappatura dell’interazione tra virus e organismo ospitante

I virus non sono in grado di replicarsi da soli. Al di fuori delle cellule ospitanti, esistono in veste di materiale genetico incapsulato in un guscio proteico; per replicarsi, essi iniettano tale materiale in una di queste cellule e si appropriano del loro processo di sintesi proteica per consentire la traduzione dell’mRNA virale sull’RNA ribosomiale dell’organismo ospitante. Ciononostante, rivelare l’essenza di questi meccanismi costituisce da tempo una sfida. Finanziato dal Consiglio europeo per l’innovazione, il progetto VirHoX si prefigge di risolvere questo problema mediante l’applicazione di un innovativo approccio per l’accoppiamento tra virus e organismo ospitante, chiamato VirHo-seq. VirHo-seq prevede la combinazione dell’RNA ribosomiale dell’organismo ospitante con l’mRNA virale nel corso della traduzione mediante enzimi ingegnerizzati e l’identificazione degli accoppiamenti tra virus e organismo ospitante attraverso il sequenziamento ad alta produttività. Il progetto sosterrà lo studio degli agenti patogeni emergenti, dei cambiamenti ecologici e delle sfide climatiche attraverso l’impiego di strumenti universali di mappatura dell’interazione tra virus e organismo ospitante.

Obiettivo

"High throughput sequencing and metagenomics have deepened our understanding of viruses in nature, yet linking viruses to their hosts remains a challenge, hindering our knowledge and applications. The VirHoX project aims to overcome this by ""hacking"" the ribosome to map virus-host associations. Leveraging a critical moment in the infection cycle of all viruses, the translation of viral genes into proteins by the host cell, we will uncover concealed relationships between viruses and their hosts, providing a universal tool for virus-host pairing. This novel approach, VirHo-seq, involves ligating host ribosomal RNA with viral mRNA during translation in infected cells using engineered enzymes, followed by high throughput sequencing to reveal virus-host pairings. Our interdisciplinary consortium of academic and industrial experts in microbiology, protein engineering, gene editing, viral genomics/transcriptomics and law, will develop and then prepare the commercialisation of VirHo-seq, envisioning legislative and analytical frameworks to maximise its impact. This technology will significantly help tackle current challenges, such as those posed by emerging pathogens, ecological disruptions, and climate change. Our approach aligns with the EIC Work Programme objectives, demonstrating feasibility on model organisms before validating on relevant samples, addressing the ""engineered living materials"" challenge."

Campo scientifico (EuroSciVoc)

Parole chiave

Programma(i)

Argomento(i)

Meccanismo di finanziamento

HORIZON-EIC - HORIZON EIC Grants

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-EIC-2024-PATHFINDEROPEN-01

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

UNIVERSITA DEGLI STUDI DI PADOVA
Contributo netto dell'UE
€ 796 000,00
Indirizzo
VIA 8 FEBBRAIO 2
35122 Padova
Italia
Regione
Nord-Est Veneto Padova
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale
€ 796 000,00

Partecipanti (8)