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Hacking the ribosome to map virus-host associations

Descrizione del progetto

L’«hacking del ribosoma» per lo sviluppo di strumenti universali di mappatura dell’interazione tra virus e organismo ospitante

I virus non sono in grado di replicarsi da soli. Al di fuori delle cellule ospitanti, esistono in veste di materiale genetico incapsulato in un guscio proteico; per replicarsi, essi iniettano tale materiale in una di queste cellule e si appropriano del loro processo di sintesi proteica per consentire la traduzione dell’mRNA virale sull’RNA ribosomiale dell’organismo ospitante. Ciononostante, rivelare l’essenza di questi meccanismi costituisce da tempo una sfida. Finanziato dal Consiglio europeo per l’innovazione, il progetto VirHoX si prefigge di risolvere questo problema mediante l’applicazione di un innovativo approccio per l’accoppiamento tra virus e organismo ospitante, chiamato VirHo-seq. VirHo-seq prevede la combinazione dell’RNA ribosomiale dell’organismo ospitante con l’mRNA virale nel corso della traduzione mediante enzimi ingegnerizzati e l’identificazione degli accoppiamenti tra virus e organismo ospitante attraverso il sequenziamento ad alta produttività. Il progetto sosterrà lo studio degli agenti patogeni emergenti, dei cambiamenti ecologici e delle sfide climatiche attraverso l’impiego di strumenti universali di mappatura dell’interazione tra virus e organismo ospitante.

Obiettivo

"High throughput sequencing and metagenomics have deepened our understanding of viruses in nature, yet linking viruses to their hosts remains a challenge, hindering our knowledge and applications. The VirHoX project aims to overcome this by ""hacking"" the ribosome to map virus-host associations. Leveraging a critical moment in the infection cycle of all viruses, the translation of viral genes into proteins by the host cell, we will uncover concealed relationships between viruses and their hosts, providing a universal tool for virus-host pairing. This novel approach, VirHo-seq, involves ligating host ribosomal RNA with viral mRNA during translation in infected cells using engineered enzymes, followed by high throughput sequencing to reveal virus-host pairings. Our interdisciplinary consortium of academic and industrial experts in microbiology, protein engineering, gene editing, viral genomics/transcriptomics and law, will develop and then prepare the commercialisation of VirHo-seq, envisioning legislative and analytical frameworks to maximise its impact. This technology will significantly help tackle current challenges, such as those posed by emerging pathogens, ecological disruptions, and climate change. Our approach aligns with the EIC Work Programme objectives, demonstrating feasibility on model organisms before validating on relevant samples, addressing the ""engineered living materials"" challenge."

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-EIC - HORIZON EIC Grants

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-EIC-2024-PATHFINDEROPEN-01

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

UNIVERSITA DEGLI STUDI DI PADOVA
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 740 000,00
Indirizzo
VIA 8 FEBBRAIO 2
35122 PADOVA
Italia

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Regione
Nord-Est Veneto Padova
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 740 000,00

Partecipanti (7)

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