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Multi-domain Open MALDI Spectra Archive for Identification of Microorganisms

Descrizione del progetto

Il potere dei microbi per le sfide globali

I microbi sono essenziali per la vita ma la loro enorme diversità è ancora poco riconosciuta nonostante il loro ruolo critico per la salute, gli ecosistemi e le industrie come l’agricoltura e la sicurezza alimentare. Un’accurata identificazione microbica è fondamentale per affrontare sfide globali come i cambiamenti climatici, le epidemie e la sicurezza alimentare. Sebbene la spettrometria di massa con desorbimento/ionizzazione laser assistito da matrice a tempo di volo (MALDI-TOF) abbia rivoluzionato la rilevazione microbica nella microbiologia clinica, il suo uso è stato limitato. Il progetto MALDIBANK, finanziato dall’UE, promuove un’omonima banca dati globale, basata su cloud, progettata per espandere l’applicazione della tecnologia MALDI-TOF. Attraverso la compilazione di 100 000 spettri di riferimento e l’utilizzo del deep learning, offre uno strumento completo per l’identificazione, la sorveglianza e la ricerca microbica, consentendo agli scienziati di affrontare la resistenza antimicrobica, il monitoraggio ambientale e altro ancora.

Obiettivo

MALDIBANK: A Comprehensive Solution to Microbial Challenges

In an era marked by pressing environmental and health challenges, including climate change, biodiversity loss, global epidemics, and food security, understanding and leveraging the power of microbes is critical. Microbes, fundamental to the biosphere, impact everything from ecosystem dynamics to human health. However, their vast diversity remains largely underestimated. To harness this potential, precise identification of microorganisms is crucial, especially given their varied implications across different sectors. Over the past 15 years, MALDI-TOF (Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight) mass spectrometry (MS) has revolutionized microbial identification in fields such as clinical microbiology, food safety, environmental monitoring, and sustainable agriculture. Despite its transformative potential, MALDI-TOF MS technology has been underutilized outside clinical microbiology. MALDIBANK emerges as a groundbreaking initiative to extend the reach of this technology, providing innovative solutions for understanding and utilizing microbial diversity for global problem-solving.

MALDIBANK is conceptualized as a global, cloud-based, open MALDI spectra databank for the identification of microorganisms, combining a vast spectrum database with advanced algorithmic tools. This databank will facilitate processing, characterization, epidemiological surveillance, and more, embodying Open Science and FAIR data principles. It aims to become a new reference in microbial identification, drawing parallels with the impact of GenBank in genomics. By integrating 100,000 reference spectra with rich metadata and employing deep learning models, MALDIBANK will enhance microbial characterization and support areas like antimicrobial resistance prediction and environmental monitoring. It will serve as a dynamic resource for the global scientific community, enabling the exploration of microbial capabilities an

Campo scientifico (EuroSciVoc)

Parole chiave

Programma(i)

Argomento(i)

Meccanismo di finanziamento

HORIZON-RIA - HORIZON Research and Innovation Actions

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-INFRA-2024-TECH-01

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

MICROBIAL RESOURCE RESEARCH INFRASTRUCTURE - EUROPEAN RESEARCH INFRASTRUCTURE CONSORTIUM
Contributo netto dell'UE
€ 741 035,00
Indirizzo
UNIVERSIDADE DO MINHO CAMPUS DE GUALTAR CP 3 PISO
4710-057 BRAGA
Portogallo
Regione
Continente Norte Cávado
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale
€ 741 035,00

Partecipanti (22)

Partner (1)