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Quantifying Evolution: a platform for the synthetic evolution of molecular ecosystems.

Projektbeschreibung

Ein Verständnis der Evolution, DNA-Strang um DNA-Strang

Die Evolution ist einer der grundlegendsten, aber gleichzeitig am wenigsten durchdrungenen Prozesse der Natur. Ein Verständnis anhand von universellen Gesetzen zu entwickeln, ist aufgrund der Komplexität biologischer Systeme und der zahlreichen Variablen in experimentellen Modellen schwierig. Das ERC-finanzierte Projekt Q-EVO nimmt sich dieses Problems mithilfe der Plattform Affinity-based DNA Synthetic Evolution (ADSE), die die Evolution auf molekularer Ebene untersucht. Durch die Verwendung von DNA-Sequenzen als Stellvertreter für Organismen bildet ADSE ökologische Wechselwirkungen wie Konkurrenz, Mutualismus und Parasitismus durch vorhersagbare DNA-DNA-Hybridisierung nach. Q-EVO kombiniert dies mit arraybasierten Biosensoren, Datenwissenschaft und theoretischer Ökologie, um Hunderte parallele Evolutionsexperimente über mehrere Generationen hinweg zu überwachen. Durch die Kartierung von Populationsdynamiken, phylogenetischen Pfaden und ökologischen Netzwerken soll die erste vollständige quantitative Beschreibung von Fitness, Artbildung und umweltbedingter Evolution geliefert werden, wobei alle Daten öffentlich zugänglich gemacht werden.

Ziel

Among the fundamental processes governing Nature, evolution is one of the most thoroughlAmong the fundamental processes governing Nature, evolution is one of the most thoroughly described and less formalized. The grand goal of describing evolution via clean universal laws is made difficult by the inherent complexity of both the biological systems and the available experimental models, which generally involve a large number of potentially relevant variables of difficult quantification.
This project is built around the Affinity-based DNA Synthetic Evolution (ADSE) platform, an experimental strategy to generate and study evolution at a molecular level that enables full quantitative description of the eco-evolutionary processes. ADSE is inspired by the in-vitro molecular selection protocol “SELEX” and enables observing the evolution across generations of large populations of DNA oligomers whose identity is given by their sequence. The key innovation is that here evolutionary mechanisms and ecological interactions (selection of the fittest, resource gathering capacity, parasitism, mutualism etc…) are given by molecular interactions based on DNA-DNA hybridization, a process that is well known and predictable from sequences.
Q-EVO is based on a combination of ADSE with an innovative array-based biosensor, approaches of data science and notions of theoretical ecology. Q-EVO aims at providing a (still missing) quantitative description of the key concepts of fitness and speciation, and of the relationship between a given environment and the evolution of its ecosystem. I propose a program capable to produce hundreds of parallel evolutions for tens of generations exploring a vast variety of conditions. Raw data, formed by hundreds of millions of reads, will be analysed to follow population dynamics, extract phylogenetic paths, parametrizing the network of ecological interactions (e.g. competitors, mutualists, parasites) and will be made public in a repository created ad hoc.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) ERC-2024-ADG

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Gastgebende Einrichtung

UNIVERSITA DEGLI STUDI DI MILANO
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 2 435 177,00
Adresse
Via Festa Del Perdono 7
20122 Milano
Italien

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Region
Nord-Ovest Lombardia Milano
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten

Begünstigte (1)

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