Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Quantifying Evolution: a platform for the synthetic evolution of molecular ecosystems.

Opis projektu

Śledzenie ewolucji, jedna nić DNA po drugiej

Ewolucja jest jednym z najbardziej podstawowych, a zarazem najmniej zbadanych procesów zachodzących w przyrodzie. Zrozumienie go w kontekście praw uniwersalnych jest trudne ze względu na złożoność systemów biologicznych i liczne zmienne w modelach eksperymentalnych. Finansowany przez ERBN projekt Q-EVO zajmuje się tym problemem, wykorzystując platformę ADSE (ang. Affinity-based DNA Synthetic Evolution), która pozwala badać ewolucję na poziomie molekularnym. Wykorzystując sekwencje DNA jako odpowiedniki organizmów, platforma ADSE odtwarza interakcje ekologiczne, takie jak konkurencja, mutualizm i pasożytnictwo, poprzez przewidywalną hybrydyzację DNA-DNA. Badacze łączą to podejście z bioczujnikami opartymi na macierzach, nauką o danych i ekologią teoretyczną, aby monitorować setki równoległych eksperymentów ewolucyjnych na przestrzeni wielu pokoleń. Celem projektu jest stworzenie pierwszego kompletnego, ilościowego opisu kondycji, specjacji i ewolucji uwarunkowanej środowiskiem poprzez mapowanie dynamiki populacji, ścieżek filogenetycznych i sieci ekologicznych, przy czym wszystkie dane mają być dostępne publicznie.

Cel

Among the fundamental processes governing Nature, evolution is one of the most thoroughlAmong the fundamental processes governing Nature, evolution is one of the most thoroughly described and less formalized. The grand goal of describing evolution via clean universal laws is made difficult by the inherent complexity of both the biological systems and the available experimental models, which generally involve a large number of potentially relevant variables of difficult quantification.
This project is built around the Affinity-based DNA Synthetic Evolution (ADSE) platform, an experimental strategy to generate and study evolution at a molecular level that enables full quantitative description of the eco-evolutionary processes. ADSE is inspired by the in-vitro molecular selection protocol “SELEX” and enables observing the evolution across generations of large populations of DNA oligomers whose identity is given by their sequence. The key innovation is that here evolutionary mechanisms and ecological interactions (selection of the fittest, resource gathering capacity, parasitism, mutualism etc…) are given by molecular interactions based on DNA-DNA hybridization, a process that is well known and predictable from sequences.
Q-EVO is based on a combination of ADSE with an innovative array-based biosensor, approaches of data science and notions of theoretical ecology. Q-EVO aims at providing a (still missing) quantitative description of the key concepts of fitness and speciation, and of the relationship between a given environment and the evolution of its ecosystem. I propose a program capable to produce hundreds of parallel evolutions for tens of generations exploring a vast variety of conditions. Raw data, formed by hundreds of millions of reads, will be analysed to follow population dynamics, extract phylogenetic paths, parametrizing the network of ecological interactions (e.g. competitors, mutualists, parasites) and will be made public in a repository created ad hoc.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2024-ADG

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Instytucja przyjmująca

UNIVERSITA DEGLI STUDI DI MILANO
Wkład UE netto
€ 2 435 177,00
Koszt całkowity
Brak danych

Beneficjenci (1)