Projektbeschreibung
DNS-Sequenzen organisieren die Chromosomen durch mechanische Eigenschaften
DNS-Sequenzen beeinflussen sowohl die Kodierung von Proteinen als auch deren mechanische Eigenschaften und wirken sich somit auf die Genregulation und die Chromatinorganisation aus. Die Bedeutung dieser mechanischen Merkmale für biologische Funktionen ist jedoch noch weitgehend unerforscht. Das über die Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahme finanzierte Projekt MECHGEN wird ein Molekulardynamik-Modell entwickeln, um herauszufinden, auf welche Weise DNS-Sequenzen die Organisation von Chromosomen verändern. Im Rahmen des Projekts wird untersucht, wie sich Sequenzen topologischer Belastungen und DNS-Schäden auf superspiralisierter DNS sowie auf die Chromatinstruktur und -funktion auswirken. Durch die Kombination von Simulationen mit experimentellen Daten soll unser Verständnis der genomischen Stabilität und der Genregulation vertieft werden. Dies könnte zu Verbesserungen bei der Behandlung genetischer Krankheiten führen.
Ziel
Beyond its role in encoding the primary structure of proteins, the sequence of DNA also determines its mechanical properties such as shape and flexibility. This sequence-specific mechanical code significantly influences interactions between the cellular machinery and the genome, affecting critical processes such as gene regulation and chromatin organization. However, the extent to which this MECHanical GENome drives biological function remains largely unexplored. MECHGEN seeks to bridge this gap by leveraging a recently developed coarse-graining methodology to construct a multi-resolution molecular dynamics (MD) model that integrates sequence-dependent elastic properties of DNA. This model will enable efficient simulations of genomic length DNA, chromatin, and other biologically relevant systems.
Using this new methodology, we propose to study two aspects of chromosomal organization. The first will investigate how DNA sequence influences the distribution of topological strains and how sequence context determines the exposure of DNA damage in supercoiled DNA, offering new insights into genomic stability and repair mechanisms. The second line of investigation will explore how DNA sequence shapes chromatin structure and function, focusing on nucleosome positioning and higher-order chromatin architectures. By combining coarse-grained simulations with experimental data, MECHGEN aims to clarify the role of sequence variations in chromosomal organization and gene regulation. These findings could significantly impact our understanding of genomic function and stability, with potential applications in the study and treatment of genetic diseases.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik DNS
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
EH8 9YL Edinburgh
Vereinigtes Königreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.