Descripción del proyecto
Descifrar la base mecánica de la regulación génica
Los nucleosomas son las unidades básicas de la cromatina y están formados por ADN enrollado alrededor de proteínas histonas. El posicionamiento de los nucleosomas es un proceso dinámico promovido por la interacción entre la secuencia de ADN, los complejos de cromatina y otros factores, lo que influye en qué regiones del ADN están accesibles para la transcripción. Nuevas pruebas sugieren que este posicionamiento también depende de las propiedades mecánicas del ADN en las regiones promotoras de los genes. El proyecto MebaGINO, financiado por las acciones Marie Skłodowska-Curie, tiene por objeto investigar los mecanismos biofísicos que determinan el posicionamiento de los nucleosomas, centrándose en la enzima INO80 de remodelación de la cromatina. Los investigadores utilizarán datos experimentales para crear un modelo biofísico que permita explicar cómo las señales mecánicas controlan la remodelación de la cromatina.
Objetivo
Recent breakthroughs found that mechanical features of gene promoters influence nucleosome positioning through ATP-dependent chromatin remodeling enzymes. This finding challenges classical models of DNA-sequence-dependent histone recruitment. While mechanisms for the translation of DNA’s physical parameters to nucleosome positions are debated, their experimental validation is still pending. MebaGINO aims to address this fundamental gap in knowledge. Taking advantage of recent advances in time-resolved CryoEM, I will answer the following research question:
What is the biophysical mechanism underlying the influence of DNA mechanics on nucleosome positioning by INO80?
I will use the INO80 chromatin remodeler as a model system to understand how nucleosomes are positioned adjacent to gene promoters featuring specific mechanical patterns. Firstly, I will interrogate how the nucleosome translocation process will be stalled through substitution of ATP with ATP-analogues on DNA with varying stiffness. From these experiments, I will obtain molecular structures via single-particle CryoEM. Next, I will obtain molecular structures from short-lived states using time-resolved CryoEM. For this, I will contribute to the development of an automated platform for CryoEM sample freezing which will be made available to the scientific community via EMBL's Electron Microscopy facility. Finally, I will build a biophysical model explaining the influence of DNA mechanics on INO80’s translocation process. Thus, I will provide novel views onto the mechanical basis of gene regulation which are relevant beyond fundamental research as for example during cancer development.
During this project, I will receive extensive training on cutting-edge structural biology instrumentation while contributing with my nanotechnology skills. Combined with my biophysics background, this fellowship will enable me to establish an interdisciplinary research group focused on structural biophysics.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias físicas óptica microscopía
- ciencias naturales ciencias biológicas biofísica
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas enzima
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
69117 Heidelberg
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.