Description du projet
La recherche met en lumière le rôle des silencers dans l’expression génétique
L’expression génétique est contrôlée par des régions génomiques appelées éléments régulateurs. Si l’on sait beaucoup de choses sur les activateurs, qui activent les gènes, les silencers, qui désactivent les gènes, restent mal connus. Avec le soutien du programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet SIRENseek vise à identifier et à caractériser les silencers et les protéines qui s’y lient afin de mieux comprendre leurs mécanismes sous-jacents. SIRENseek combinera des méthodes avancées pour identifier ces protéines, évaluer la façon dont elles interagissent avec les silencers et explorer la façon dont les silencers modifient la structure 3D de l’ADN pour désactiver les gènes. La recherche proposée permettra de cartographier les silencers de manière systématique, ce qui améliorera la compréhension du contrôle des gènes et pourrait déboucher sur de nouveaux traitements.
Objectif
"Distal regulatory elements in the genome play a key role in orchestrating tissue- and context- specific transcriptional programs. While activating elements (enhancers) have been broadly studied in the last decades, repressive elements (silencers) remain a ‘mysterious’ class of regulatory regions of the genome, whose characteristics have never been systematically elucidated.
In the ""seeking the SIlencer-associated REpressive protein Network” (SIRENseek) project, I aim to identify and functionally characterize silencers and silencer-binding proteins (SBPs) to gain insight into their mechanism of action and ultimately unlock their untapped potential for gene regulation and targeted therapy. To this aim, I will combine state-of-the-art proteomic analyses and high-throughput epigenomic profiling to identify SBPs and assess their relevance in shaping the chromatin landscape. First, I will focus on a repressive transcription factor known to bind silencers and I will use novel proximity labeling technologies to isolate its interacting proteins, thus unveiling other chromatin factors involved in silencer functions. Then, I will interrogate multiple candidate SBPs via a CRISPR screening and test their ability to rewire the chromatin landscape via ATAC-seq. Finally, by integrating this information with epigenomic data, I will identify SBPs with a functional role at silencers and test their ability to establish long-range chromatin interactions via 3D genomic approaches.
Together, this interdisciplinary proposal will allow me to map for the first time silencer elements, their associated chromatin factors and the potential 3D interactions that they mediate to repress target genes, thus addressing the existing gap in our understanding of repressive elements."
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
20121 Milano
Italie
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.