Projektbeschreibung
Forschung beleuchtet die Rolle von Silencer bei der Genexpression
Die Genexpression wird durch genomische Regionen gesteuert, die als regulatorische Elemente bezeichnet werden. Während über die Enhancer, die Gene aktivieren, viel bekannt ist, sind die Silencer, die Gene ausschalten, nach wie vor kaum erforscht. Das im Rahmen der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen geförderte Projekt SIRENseek hat zum Ziel, Silencer und die an sie bindenden Proteine zu identifizieren und zu charakterisieren, um weitere Erkenntnisse über ihre zugrunde liegenden Mechanismen zu gewinnen. SIRENseek wird fortgeschrittene Methoden kombinieren, um diese Proteine zu identifizieren, ihre Interaktion mit Silencern zu bewerten und zu untersuchen, wie Silencer die 3D-Struktur der DNA verändern, um Gene auszuschalten. Diese geplante Forschung wird Silencer systematisch kartieren und dadurch das Verständnis der Genregulation verbessern und möglicherweise zu neuen Behandlungsmethoden führen.
Ziel
"Distal regulatory elements in the genome play a key role in orchestrating tissue- and context- specific transcriptional programs. While activating elements (enhancers) have been broadly studied in the last decades, repressive elements (silencers) remain a ‘mysterious’ class of regulatory regions of the genome, whose characteristics have never been systematically elucidated.
In the ""seeking the SIlencer-associated REpressive protein Network” (SIRENseek) project, I aim to identify and functionally characterize silencers and silencer-binding proteins (SBPs) to gain insight into their mechanism of action and ultimately unlock their untapped potential for gene regulation and targeted therapy. To this aim, I will combine state-of-the-art proteomic analyses and high-throughput epigenomic profiling to identify SBPs and assess their relevance in shaping the chromatin landscape. First, I will focus on a repressive transcription factor known to bind silencers and I will use novel proximity labeling technologies to isolate its interacting proteins, thus unveiling other chromatin factors involved in silencer functions. Then, I will interrogate multiple candidate SBPs via a CRISPR screening and test their ability to rewire the chromatin landscape via ATAC-seq. Finally, by integrating this information with epigenomic data, I will identify SBPs with a functional role at silencers and test their ability to establish long-range chromatin interactions via 3D genomic approaches.
Together, this interdisciplinary proposal will allow me to map for the first time silencer elements, their associated chromatin factors and the potential 3D interactions that they mediate to repress target genes, thus addressing the existing gap in our understanding of repressive elements."
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
Sie müssen sich anmelden oder registrieren, um diese Funktion zu nutzen
Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
-
HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
HAUPTPROGRAMM
Alle im Rahmen dieses Programms finanzierten Projekte anzeigen
Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigenKoordinator
Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
20121 Milano
Italien
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.