Opis projektu
Badania rzucają światło na rolę sekwencji wyciszającej w ekspresji genów
Ekspresja genów jest kontrolowana przez regiony genomu zwane sekwencjami regulatorowymi. Chociaż wiele wiemy o sekwencjach wzmacniających, które aktywują geny, sekwencje wyciszające, które wyłączają geny pozostają słabo poznane. Projekt SIRENseek, realizowany przy wsparciu programu działania „Maria Skłodowska-Curie”, ma na celu zidentyfikowanie i scharakteryzowanie sekwencji wyciszających oraz białek, które się z nimi wiążą, aby uzyskać więcej informacji na temat stojących za tym mechanizmów. Zespół projektu SIRENseek połączy zaawansowane metody do identyfikacji tych białek, oceni ich interakcje z sekwencjami wyciszającymi oraz odkryje jak sekwencje te zmieniają trójwymiarową strukturę DNA, aby wyłączać geny. Proponowane badania systematycznie zmapują sekwencje wyciszające, tym samym pomagając nam lepiej zrozumieć regulację genów, co potencjalnie może doprowadzić do nowych terapii.
Cel
"Distal regulatory elements in the genome play a key role in orchestrating tissue- and context- specific transcriptional programs. While activating elements (enhancers) have been broadly studied in the last decades, repressive elements (silencers) remain a ‘mysterious’ class of regulatory regions of the genome, whose characteristics have never been systematically elucidated.
In the ""seeking the SIlencer-associated REpressive protein Network” (SIRENseek) project, I aim to identify and functionally characterize silencers and silencer-binding proteins (SBPs) to gain insight into their mechanism of action and ultimately unlock their untapped potential for gene regulation and targeted therapy. To this aim, I will combine state-of-the-art proteomic analyses and high-throughput epigenomic profiling to identify SBPs and assess their relevance in shaping the chromatin landscape. First, I will focus on a repressive transcription factor known to bind silencers and I will use novel proximity labeling technologies to isolate its interacting proteins, thus unveiling other chromatin factors involved in silencer functions. Then, I will interrogate multiple candidate SBPs via a CRISPR screening and test their ability to rewire the chromatin landscape via ATAC-seq. Finally, by integrating this information with epigenomic data, I will identify SBPs with a functional role at silencers and test their ability to establish long-range chromatin interactions via 3D genomic approaches.
Together, this interdisciplinary proposal will allow me to map for the first time silencer elements, their associated chromatin factors and the potential 3D interactions that they mediate to repress target genes, thus addressing the existing gap in our understanding of repressive elements."
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
20121 Milano
Włochy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.