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Building Invariant Representations: Computational Innovations for Cryo-ET Data Analysis

Ziel

Cryo-Electron Tomography (Cryo-ET) is a powerful technique that allows observing the 3D structure of biological molecules in their native cellular environment, and as such, has a unique promise to transform our understanding of biology at the mesoscopic level. Currently, its full impact is constrained by the difficulties associated with interpreting the 3D tomograms in terms of the molecular reality they represent (the so-called assignment problem), which mainly happens due to low resolution and noise inherent to the method.

Our research goal is to develop innovative and highly efficient computational tools that will help to overcome the existing challenges and help to address the assignment problem. We shall achieve this goal by building invariant representations of 3D volumetric data that will allow us to significantly speed up the processing of tomograms and expand the scale and accuracy of the analysis that can be performed. This mathematical foundation will allow us to strengthen both template-based and template-free approaches to the assignment problem, addressing the critical weaknesses of the current state of the art, specifically, the high computational costs of the former and dependence on scarce training data of the latter. To demonstrate the whole capacity of our approach, we shall apply it to novel tomograms of highly important whole-cell biological samples obtained by our experimental collaborators.

This highly multidisciplinary project (math+computation+biology) rests on the unique theoretical/computational competencies brought by the supervisor and the candidate, and involves a key experimental collaboration, bolstering the exchange of scientific knowledge. The planned training of the candidate in mathematical/algorithmic methods, the peculiarities of the Cryo-ET data, and key transversal skills will strengthen his profile as a specialist in integrative molecular modeling and ensure a successful transition to the next career stage.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 226 420,56
Adresse
RUE MICHEL ANGE 3
75794 PARIS
Frankreich

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Region
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Aktivitätstyp
Research Organisations
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten
Mein Booklet 0 0