Descripción del proyecto
Redes neuronales gráficas con interpretabilidad espectral para modelizar potenciales de interacción molecular
Las redes neuronales gráficas empleadas para modelizar potenciales de interacción molecular tienen una gran importancia en el desarrollo de nuevos fármacos y materiales. Sin embargo, la complejidad de los modelos resultantes es tan alta que puede dificultar determinar qué interacciones moleculares son más importantes. En el proyecto SIMPL, que cuenta con el apoyo de las acciones Marie Skłodowska-Curie, se pretende mejorar la interpretabilidad y fiabilidad de las redes neuronales gráficas. Para ello, se diseñarán redes neuronales gráficas integradas con la teoría espectral de grafos y la topología algebraica para, de este modo, racionalizar los modelos e identificar las interacciones más importantes. A continuación, este marco se empleará para estudiar procesos de reconocimiento inmunitario, como la unión entre péptidos y el complejo principal de histocompatibilidad. Los resultados del proyecto podrían contribuir a optimizar la inmunoterapia y el desarrollo de nuevas vacunas.
Objetivo
The SIMPL project (Spectral Interpretability for Molecular Interaction PotentiaLs) is designed to enhance the interpretability and efficiency of Graph Neural Networks (GNNs) used to model Molecular Interaction Potentials (MIPs). GNNs have greatly advanced the prediction of molecular interactions, which is crucial for fields like drug discovery and material science. However, the complexity of these models often makes it challenging to identify which molecular interactions are most critical, limiting their practical application. SIMPL addresses this challenge by incorporating Spectral Graph Theory and Algebraic Topology into GNNs, allowing for clearer interpretation and streamlined models, focusing on the most relevant interactions without sacrificing accuracy. Compared to traditional gradient-based methods, which can be unstable and sensitive to specific molecular conformations, SIMPL offers a robust approach. Instead of a localized insights that could vary significantly depending on the particular state of the molecule or be subject to vanishing or exploding gradients problems (especially in complex models), SIMPL provides a global perspective by assessing the relevance of interactions across the entire learning task. This ensure that the identified interactions are consistently important and reliable. This approach in practice forces a multi-body expansion of the MIP leading to a comprehensive understanding of molecular systems.
While SIMPL has broad applications, it will be applied to the study of immune recognition processes, such as peptide-Major Histocompatibility Complex (MHC) binding. The framework’s ability to reliably identify critical molecular interactions could significantly enhance our understanding of these processes, leading to more informed approaches in immunotherapy and vaccine development.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales matemáticas matemáticas puras topología
- ciencias médicas y de la salud medicina básica farmacología y farmacia medicamento vacuna
- ciencias médicas y de la salud medicina básica inmunología inmunoterapia
Para utilizar esta función, debe iniciar sesión o registrarse
Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
-
HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMA PRINCIPAL
Ver todos los proyectos financiados en el marco de este programa
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoriaCoordinador
Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
14195 Berlin
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.