Opis projektu
Grafowe sieci neuronowe z możliwością interpretacji spektralnej do modelowania potencjałów oddziaływań molekularnych
Grafowe sieci neuronowe (ang. graph neural networks, GNN) wykorzystywane do modelowania potencjałów oddziaływań międzycząsteczkowych są nieocenione przy opracowywaniu nowych leków i materiałów. Jednak modele te często są na tyle złożone, że utrudnia to określenie, które oddziaływania molekularne są najbardziej kluczowe. Z tego względu, korzystając ze wsparcia programu działań „Maria Skłodowska-Curie”, zespół projektu SIMPL dąży do poprawy interpretowalności i wiarygodności grafowych sieci neuronowych. W tym celu zaprojektuje sieci GNN połączone z teorią grafów spektralnych i topologią algebraiczną, aby usprawnić modele i móc określić najważniejsze oddziaływania. Ramy te zostaną następnie zastosowane do badania mechanizmów rozpoznawania immunologicznego, takich jak wiązanie peptydu z głównym układem zgodności tkankowej. W ten sposób wyniki uzyskane w projekcie mogą przyczynić się do zwiększenia efektywności prac nad immunoterapiami i szczepionkami.
Cel
The SIMPL project (Spectral Interpretability for Molecular Interaction PotentiaLs) is designed to enhance the interpretability and efficiency of Graph Neural Networks (GNNs) used to model Molecular Interaction Potentials (MIPs). GNNs have greatly advanced the prediction of molecular interactions, which is crucial for fields like drug discovery and material science. However, the complexity of these models often makes it challenging to identify which molecular interactions are most critical, limiting their practical application. SIMPL addresses this challenge by incorporating Spectral Graph Theory and Algebraic Topology into GNNs, allowing for clearer interpretation and streamlined models, focusing on the most relevant interactions without sacrificing accuracy. Compared to traditional gradient-based methods, which can be unstable and sensitive to specific molecular conformations, SIMPL offers a robust approach. Instead of a localized insights that could vary significantly depending on the particular state of the molecule or be subject to vanishing or exploding gradients problems (especially in complex models), SIMPL provides a global perspective by assessing the relevance of interactions across the entire learning task. This ensure that the identified interactions are consistently important and reliable. This approach in practice forces a multi-body expansion of the MIP leading to a comprehensive understanding of molecular systems.
While SIMPL has broad applications, it will be applied to the study of immune recognition processes, such as peptide-Major Histocompatibility Complex (MHC) binding. The framework’s ability to reliably identify critical molecular interactions could significantly enhance our understanding of these processes, leading to more informed approaches in immunotherapy and vaccine development.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze matematyka matematyka czysta topologia
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna farmakologia i farmacja lek szczepionki
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna immunologia immunoterapia
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
14195 Berlin
Niemcy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.