Descripción del proyecto
Mecanismos moleculares del sistema Shango
Los sistemas CRISPR-Cas han avanzado en la edición del genoma, mientras que las bacterias utilizan más de ciento treinta módulos de genes como mecanismos de defensa contra los fagos. El sistema Shango, un módulo de defensa antifágica bacteriana, está formado por tres genes centrales (SngA, SngB y SngC) que probablemente contribuyen a la remodelación del ADN. Con el apoyo de las acciones Marie Skłodowska-Curie, el proyecto SHARP investigará los mecanismos moleculares del sistema Shango aislando variantes de fagos que evadan su defensa. El proyecto pretende identificar las señales desencadenantes. Mediante técnicas avanzadas como la microscopía electrónica criogénica y la microscopía de fluorescencia de reflexión interna total, examinará los estados funcionales de Shango, con el objetivo de visualizar la colocalización de las proteínas de Shango y los fagos durante los ataques.
Objetivo
The SHARP (Shango Anti-phage Remodeling Pathway) project aims to explore the molecular mechanism of Shango system, a widespread bacterial anti-phage defense module. While the well-known CRISPR-Cas systems have revolutionized genome editing, bacterial defense strategies encompass over 130 distinct gene modules and present a treasure chest for novel biotechnologies. To eliminate viral threats, these systems employ various mechanisms, either pre- or post-injection. Shango consists of three core genes: SngA, SngB, and SngC with bioinformatically predicted functions thus far. SngA, annotated as tellurite stress response element, has two transmembrane helices and is proposed to detect an unknown viral signal. Its C-terminal domain may recruit SngB and SngC. SngB, a member of the AAA+ ATPase family, together with SngC, a DEAD-box helicase, likely participates in DNA remodeling.
In this project, I hypothesize that Shango induces changes in nucleic acid topology, thus impairing phage genome integrity and preventing its replication, though the exact mechanism remains elusive. By isolating phage escapers capable of bypassing Shango, I aim to identify the triggering signal. Subsequently, I will analyze the specificity and unwinding activity of SngB and SngC using biochemical assays. Advanced techniques such as single-particle cryogenic electron microscopy (cryo-EM) will be used to elucidate distinct functional states of Shango. Leveraging Dr. N. Taylor’s expertise, I aim to assemble the complete complex of Shango together with its transmembrane helices. To reveal the spatial-temporal regulation of the system during phage attack, I will employ Total Internal Reflection Fluorescence (TIRF) microscopy to visualize the co-localization of Shango proteins and phages. This project not only explores new aspects of bacterial stress responses, but also aims to pioneer tools for signal-induced nucleic acid manipulations, opening up the possibilities in biotechnological applications.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas ácido nucleico
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología virología
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias físicas óptica microscopía electron microscopy
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
1165 KOBENHAVN
Dinamarca
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.