Description du projet
Mécanismes moléculaires du système Shango
Les systèmes CRISPR-Cas ont fait progresser l’édition du génome, tandis que les bactéries utilisent plus de 130 modules génétiques comme mécanismes de défense contre les phages. Le système Shango, un module de défense bactérienne contre les phages, se compose de trois gènes principaux (SngA, SngB et SngC) qui contribuent probablement au remodelage de l’ADN. Soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet SHARP étudiera les mécanismes moléculaires du système Shango en isolant des variantes de phages qui échappent à sa défense. Le projet vise à identifier les signaux déclencheurs. En utilisant des techniques avancées telles que la microscopie électronique cryogénique (ME-cryo) et la microscopie de fluorescence à réflexion interne totale, il examinera les états fonctionnels de Shango, dans le but de visualiser la co-localisation des protéines de Shango et des phages pendant les attaques.
Objectif
The SHARP (Shango Anti-phage Remodeling Pathway) project aims to explore the molecular mechanism of Shango system, a widespread bacterial anti-phage defense module. While the well-known CRISPR-Cas systems have revolutionized genome editing, bacterial defense strategies encompass over 130 distinct gene modules and present a treasure chest for novel biotechnologies. To eliminate viral threats, these systems employ various mechanisms, either pre- or post-injection. Shango consists of three core genes: SngA, SngB, and SngC with bioinformatically predicted functions thus far. SngA, annotated as tellurite stress response element, has two transmembrane helices and is proposed to detect an unknown viral signal. Its C-terminal domain may recruit SngB and SngC. SngB, a member of the AAA+ ATPase family, together with SngC, a DEAD-box helicase, likely participates in DNA remodeling.
In this project, I hypothesize that Shango induces changes in nucleic acid topology, thus impairing phage genome integrity and preventing its replication, though the exact mechanism remains elusive. By isolating phage escapers capable of bypassing Shango, I aim to identify the triggering signal. Subsequently, I will analyze the specificity and unwinding activity of SngB and SngC using biochemical assays. Advanced techniques such as single-particle cryogenic electron microscopy (cryo-EM) will be used to elucidate distinct functional states of Shango. Leveraging Dr. N. Taylor’s expertise, I aim to assemble the complete complex of Shango together with its transmembrane helices. To reveal the spatial-temporal regulation of the system during phage attack, I will employ Total Internal Reflection Fluorescence (TIRF) microscopy to visualize the co-localization of Shango proteins and phages. This project not only explores new aspects of bacterial stress responses, but also aims to pioneer tools for signal-induced nucleic acid manipulations, opening up the possibilities in biotechnological applications.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule acide nucléique
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie virologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie electron microscopy
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
1165 KOBENHAVN
Danemark
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.