Opis projektu
Mechanizmy molekularne układu Shango
Rozwiązania CRISPR-Cas pozwoliły na rozwój edycji genomu, natomiast bakterie wykorzystują ponad 130 modułów genowych jako mechanizmy obronne przed fagami. Układ Shango, bakteryjny moduł obrony przed fagami, składa się z trzech podstawowych genów (SngA, SngB i SngC), które prawdopodobnie przyczyniają się do przebudowy DNA. Projekt SHARP realizowany przy wsparciu programu działań „Maria Skłodowska-Curie” zbada mechanizmy molekularne systemu Shango. W tym celuje odizoluje warianty fagów, które unikają jego obrony. Projekt ma na celu zidentyfikowanie sygnałów wyzwalających. Zespół badaczy, wykorzystując zaawansowane techniki, takie jak kriogeniczna mikroskopia elektronowa (cryo-EM) i mikroskopia fluorescencyjna całkowitego wewnętrznego odbicia, zbada stany funkcjonalne Shango, aby zwizualizować kolokalizację białek Shango i fagów podczas ataków.
Cel
The SHARP (Shango Anti-phage Remodeling Pathway) project aims to explore the molecular mechanism of Shango system, a widespread bacterial anti-phage defense module. While the well-known CRISPR-Cas systems have revolutionized genome editing, bacterial defense strategies encompass over 130 distinct gene modules and present a treasure chest for novel biotechnologies. To eliminate viral threats, these systems employ various mechanisms, either pre- or post-injection. Shango consists of three core genes: SngA, SngB, and SngC with bioinformatically predicted functions thus far. SngA, annotated as tellurite stress response element, has two transmembrane helices and is proposed to detect an unknown viral signal. Its C-terminal domain may recruit SngB and SngC. SngB, a member of the AAA+ ATPase family, together with SngC, a DEAD-box helicase, likely participates in DNA remodeling.
In this project, I hypothesize that Shango induces changes in nucleic acid topology, thus impairing phage genome integrity and preventing its replication, though the exact mechanism remains elusive. By isolating phage escapers capable of bypassing Shango, I aim to identify the triggering signal. Subsequently, I will analyze the specificity and unwinding activity of SngB and SngC using biochemical assays. Advanced techniques such as single-particle cryogenic electron microscopy (cryo-EM) will be used to elucidate distinct functional states of Shango. Leveraging Dr. N. Taylor’s expertise, I aim to assemble the complete complex of Shango together with its transmembrane helices. To reveal the spatial-temporal regulation of the system during phage attack, I will employ Total Internal Reflection Fluorescence (TIRF) microscopy to visualize the co-localization of Shango proteins and phages. This project not only explores new aspects of bacterial stress responses, but also aims to pioneer tools for signal-induced nucleic acid manipulations, opening up the possibilities in biotechnological applications.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki kwas nukleinowy
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne mikrobiologia wirusologia
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka DNA
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka
- nauki przyrodnicze nauki fizyczne optyka mikroskopia electron microscopy
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
1165 KOBENHAVN
Dania
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.