Projektbeschreibung
Molekulare Mechanismen des Shango-Systems
CRISPR-Cas-Systeme haben die Genomeditierung vorangebracht, während Bakterien über 130 Genmodule als Abwehrmechanismen gegenüber Phagen einsetzen. Das Shango-System, ein bakterielles Anti-Phagen-Abwehrmodul, besteht aus drei Kerngenen (SngA, SngB und SngC), die wahrscheinlich zur DNS-Remodellierung beitragen. Im Rahmen des innerhalb der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen unterstützten Projekts SHARP werden die molekularen Mechanismen des Shango-Systems untersucht. Dazu werden Phagenvarianten isoliert, die dessen Abwehr umgehen. Projektziel ist es, auslösende Signale zu identifizieren. Mithilfe fortgeschrittener Verfahren wie der Kryo-Elektronenmikroskopie und der Internen Totalreflexionsfluoreszenzmikroskopie werden Shango-Funktionszustände erkundet. Das Ziel lautet, die Kolokalisierung von Shango-Proteinen und Phagen bei Angriffen zu visualisieren.
Ziel
The SHARP (Shango Anti-phage Remodeling Pathway) project aims to explore the molecular mechanism of Shango system, a widespread bacterial anti-phage defense module. While the well-known CRISPR-Cas systems have revolutionized genome editing, bacterial defense strategies encompass over 130 distinct gene modules and present a treasure chest for novel biotechnologies. To eliminate viral threats, these systems employ various mechanisms, either pre- or post-injection. Shango consists of three core genes: SngA, SngB, and SngC with bioinformatically predicted functions thus far. SngA, annotated as tellurite stress response element, has two transmembrane helices and is proposed to detect an unknown viral signal. Its C-terminal domain may recruit SngB and SngC. SngB, a member of the AAA+ ATPase family, together with SngC, a DEAD-box helicase, likely participates in DNA remodeling.
In this project, I hypothesize that Shango induces changes in nucleic acid topology, thus impairing phage genome integrity and preventing its replication, though the exact mechanism remains elusive. By isolating phage escapers capable of bypassing Shango, I aim to identify the triggering signal. Subsequently, I will analyze the specificity and unwinding activity of SngB and SngC using biochemical assays. Advanced techniques such as single-particle cryogenic electron microscopy (cryo-EM) will be used to elucidate distinct functional states of Shango. Leveraging Dr. N. Taylor’s expertise, I aim to assemble the complete complex of Shango together with its transmembrane helices. To reveal the spatial-temporal regulation of the system during phage attack, I will employ Total Internal Reflection Fluorescence (TIRF) microscopy to visualize the co-localization of Shango proteins and phages. This project not only explores new aspects of bacterial stress responses, but also aims to pioneer tools for signal-induced nucleic acid manipulations, opening up the possibilities in biotechnological applications.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Nukleinsäure
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
1165 KOBENHAVN
Dänemark
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.