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Exploring the structure and function of NUDT5 in de novo purine synthesis

Description du projet

La découverte d’un acteur caché du métabolisme du cancer

Les cellules cancéreuses ont besoin de grandes quantités d’énergie et d’éléments constitutifs moléculaires pour proliférer. Parmi ces substances figurent les nucléotides puriques, des molécules qui servent d’éléments constitutifs de l’ADN et de l’ARN. L’enzyme NUDT5 est récemment apparue comme un acteur clé du métabolisme cellulaire, influençant la production de purines de manière inattendue. Au-delà de son rôle catalytique, NUDT5 peut également servir d’échafaudage pour organiser les complexes protéiques lors de la synthèse des nucléotides. Soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet purine synthesis disséquera le mécanisme moléculaire du mode d’action de NUDT5. Dans ce contexte, les chercheurs auront recours à la protéomique, à la métabolomique et à la biologie structurale. En révélant comment NUDT5 régule le métabolisme du cancer, ce projet ouvrira la voie à des traitements innovants.

Objectif

Proliferation of tumour cells requires continuous DNA synthesis and energy supply. Purine nucleotides are essential building blocks for DNA. Recent research has highlighted the role of NUDIX hydrolase 5 (NUDT5) catalytic activity in nuclear ATP metabolism in breast cancer. Notably, NUDT5 has also been suggested as a more general prognostic marker for various cancers, and NUDT5 depletion leads to suppression of tumour cell proliferation in a variety of model systems. Strikingly, the host lab has recently discovered that NUDT5 possesses an unexpected non-enzymatic, likely scaffolding role in de novo purine synthesis. This observation is unprecedented for a catalytically active member of the NUDIX family.
In this project, I aim to dissect the molecular mechanism and reveal the structural basis of NUDT5-regulated purine metabolism by combining Affinity Purification Mass Spectrometry (AP-MS) proteomics and metabolomics with X-ray crystallography and cryogenic Electron Microscopy (cryo-EM) with three main goals:
(1) Unravel the molecular mechanism and role of NUDT5 in purine synthesis using a comparative metabolomics and proteomics approach using CRISPR knock out (KO) cell lines, small molecule inhibitors and degraders of NUDT5 in relevant cell line models.
(2) Identify and define the NUDT5 interactome via AP-MS, and validate candidate NUDT5 interactors in biophysical and functional assays using purified proteins and cellular models.
(3) Explore NUDT5 protein complexes using X-ray crystallography and cryo-EM to dissect the molecular interaction between NUDT5 and complex partners for regulation of purine synthesis.
This work will offer novel fundamental insights into the molecular mechanism of NUDT5-mediated purine metabolism, and the scaffolding role of this enzyme to provide new perspectives on cellular metabolism and potential anti-tumour drug development.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

THE CHANCELLOR, MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF OXFORD
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 276 187,92
Adresse
WELLINGTON SQUARE UNIVERSITY OFFICES
OX1 2JD Oxford
Royaume-Uni

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Région
South East (England) Berkshire, Buckinghamshire and Oxfordshire Oxfordshire
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

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