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Machine Learning-Enhanced Coarse-Grained Modelling of Telomeric G-Quadruplex Multimers: A Multiscale Study

Projektbeschreibung

G4-Multimere unter dem Mikroskop

G-Quadruplex-Multimere (G4) sind einzigartige DNS-Strukturen, die bei höheren Eukaryoten vorkommen. Es wird angenommen, dass sie bei biologischen Prozessen wesentliche Funktionen übernehmen. Da sie fähig sind, die Telomerase in Telomeren zu hemmen, wurde Interesse an ihnen als potenzielle Ziele für Krebsmedikamente geweckt. Das Team des innerhalb der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen unterstützten Projekts MCG-QUAD wird eine integrative Studie über G4-Multimere durchführen und dabei ein Rahmenwerk zur Interpretation experimenteller Daten und Verbindung mikroskopischen Bildmaterials mit makroskopischen Beobachtungen mithilfe der Anwendung eines innovativen In-silico-Multiskalenansatzes entwickeln. Diese Lösungen werden dazu beitragen, unser Verständnis von G4-Multimeren und ihrer Dynamik in telomeren Sequenzen zu erweitern, wodurch viele wichtige Durchbrüche auf den Weg gebracht werden.

Ziel

MCG-QUAD is an integrative study of G-quadruplex (G4) multimers—noncanonical DNA structures—providing a framework to interpret experimental data and connect a microscopic view to macroscopic observables through a novel multiscale in silico approach. G4s are ubiquitous in the genomes of higher eukaryotes and are believed to play key roles in various biological processes. The presence of G4s in the telomeric region has been shown to inhibit telomerase, opening the possibility for G4-stabilizing compounds to be used as anticancer medications. Sequences that form G4s exhibit long folding timescales. G4s are highly polymorphic structures with long-living quasi-stable topologies, a complexity further compounded in multimers. Structural information on G4 multimers is limited, and existing data often lack physiological context. A novel computational approach is necessary to address open questions about the folding/unfolding dynamics of telomeric sequences into G4 multimers, their structure, topological phase space, the role of crowders, and the effects of ligands on G4 formation, stabilization, and properties. Through a combination of classical bottom-up coarse-graining and recent developments in machine learning, MCG-QUAD provides scalable and accurate models that enable bulk, long-timescale simulations. These simulations will be combined with in vitro observables to elucidate previously inaccessible phenomenology, forming an integrative study of G4 multimers in crowded environments. Furthermore, MCG-QUAD explores the interaction of G4 multimers with ligands to inform the design of new anticancer drugs, pushing beyond the limitations of existing in vitro and in silico studies. In collaboration with leading experts and institutions, MCG-QUAD will generate knowledge for the development of effective G4-targeting therapies and a broader understanding of biomolecular behaviour in complex environments, extending beyond cancer research.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

UNIVERSITA DEGLI STUDI DI ROMA LA SAPIENZA
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 209 483,28
Adresse
Piazzale Aldo Moro 5
00185 Roma
Italien

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Region
Centro (IT) Lazio Roma
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten
Mein Booklet 0 0