Description du projet
Identifier et caractériser les récepteurs de liaison à la di-GMPc chez les bactéries
La di-GMP cyclique (di-GMPc) est une molécule bactérienne «second messager» qui joue un rôle crucial dans la régulation d’un large éventail de processus cellulaires, notamment la formation de biofilms, la motilité, la progression du cycle cellulaire et la virulence. Les récepteurs qui lient la di-GMPc sont essentiels à la médiation de ces réponses intracellulaires. Cependant, leur diversité compliquent leur caractérisation et empêche donc de mieux comprendre la régulation complexe des voies microbiennes qui contribuent à l’adaptation exceptionnelle et à l’évolution des bactéries. Avec le soutien du programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet CdiGMPBP se propose d’exploiter un nouveau crible pour les protéines liant la di-GMPc, basé sur des altérations de la stabilité thermique, afin de combler d’importantes lacunes de connaissances.
Objectif
Nucleotide signaling plays an important role in the adjustment of microbial physiology and metabolism. These signaling systems are involved in the regulation of all physiological processes including biofilm formation, virulence, environmental survival, and phage defense. One of the most prominent nucleotide-based second messenger molecules is the ubiquitous second messenger cyclic di-GMP. Cyclic di‐GMP synthesizing and hydrolyzing proteins, GGDEF and EAL domain proteins, respectively, are widely present across bacterial phyla, numerous within genomes, and highly conserved throughout the phylogenetic tree. However, there is still limited understanding of c-di-GMP binding receptors, since they are diverse, not necessarily characterized by common signature binding motifs, and still require experimentation to be identified.
Having established a novel screen for cyclic di-GMP binding proteins based on alterations in thermal stability (PISA), this project aims to identify and characterize novel c-di-GMP binding receptors of the gastrointestinal pathogen Salmonella typhimurium as a model organism. Candidate c-di-GMP binding proteins will be verified by alternative approaches. Verified receptors will be assessed using microbiology, biochemistry, molecular biology, bioinformatics, and genetic engineering approaches. While new cyclic di-GMP binding proteins will be predominantly characterized in Salmonella typhimurium, novel and improved screens for cyclic di-GMP binding proteins based on mass-spectrometry-based DRaCALA and isolation of cellular nanomachines like ribosomes will be developed and partially investigated as research resources. Successful conduction of this post-doctoral project will expand the number of c-di-GMP receptors, discover novel underlying mechanisms of regulation by c-di-GMP, and thus significantly improve our understanding of the multilayer regulation of microbial pathways that contribute to the exceptional adaptation and evolution of bacteria.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie virologie
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
- sciences naturelles sciences biologiques biologie moléculaire
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
171 77 STOCKHOLM
Suède
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.