Objetivo
The phosphate chemistry of nucleoside triphosphates (NTPs) is at the heart of crucial biological processes including the cell’s energy storage, signalling and copying genetic information. Computational modelling valuably expands the spatiotemporal resolution of experimental structural biology, providing a key contribution to the synergistic understanding of such complex processes.
However, our preliminary results on phosphatase reactions shed light on the qualitative inaccuracy of the state-of-the-art methodology capable of free energy bio-simulations.
Thus, the candidate will be trained to extend the host’s uniquely accurate and efficient electronic structure approaches to the scale of enzyme simulations, producing thermodynamic properties comparable to experiments. The candidate brings complementary computational biochemistry experience and reaction mechanistic knowledge to this collaboration, demonstrated in his successful computational-experimental phosphate catalytic enzyme studies. Our concerted developments will combine methods from the forefront of quantum chemistry, high-performance computing, rare event molecular dynamics, and biochemical modelling into a widely applicable open-access protocol, with a predictive power currently limited to main-group homogeneous catalysis modelling.
The reliability of the reaction mechanisms predicted by the developed method will be validated against kinetic experiments on wild-type and mutant Ras GTPases, connected to ca. one third of the cancer cell lines. Then, we will utilise the established protocol to understand the (regular and faulty) binding and incorporation of deoxy-NTPs and nucleoside analogue drugs during mitochondrial DNA polymerisation to a yet unknown atomistic detail. These results will provide a foundation for a comprehensive kinetic model for DNA polymerase fidelity and for the future rational optimisation of more selective and less toxic antiretrovirals.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias médicas y de la salud medicina clínica oncología
- ciencias naturales ciencias químicas catálisis
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas enzima
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
1111 BUDAPEST
Hungría
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.