Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Development of a predictive quantum simulation protocol for understanding DNA polymerase function and toxic inhibition

Cel

The phosphate chemistry of nucleoside triphosphates (NTPs) is at the heart of crucial biological processes including the cell’s energy storage, signalling and copying genetic information. Computational modelling valuably expands the spatiotemporal resolution of experimental structural biology, providing a key contribution to the synergistic understanding of such complex processes.
However, our preliminary results on phosphatase reactions shed light on the qualitative inaccuracy of the state-of-the-art methodology capable of free energy bio-simulations.

Thus, the candidate will be trained to extend the host’s uniquely accurate and efficient electronic structure approaches to the scale of enzyme simulations, producing thermodynamic properties comparable to experiments. The candidate brings complementary computational biochemistry experience and reaction mechanistic knowledge to this collaboration, demonstrated in his successful computational-experimental phosphate catalytic enzyme studies. Our concerted developments will combine methods from the forefront of quantum chemistry, high-performance computing, rare event molecular dynamics, and biochemical modelling into a widely applicable open-access protocol, with a predictive power currently limited to main-group homogeneous catalysis modelling.

The reliability of the reaction mechanisms predicted by the developed method will be validated against kinetic experiments on wild-type and mutant Ras GTPases, connected to ca. one third of the cancer cell lines. Then, we will utilise the established protocol to understand the (regular and faulty) binding and incorporation of deoxy-NTPs and nucleoside analogue drugs during mitochondrial DNA polymerisation to a yet unknown atomistic detail. These results will provide a foundation for a comprehensive kinetic model for DNA polymerase fidelity and for the future rational optimisation of more selective and less toxic antiretrovirals.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.

Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować

Słowa kluczowe

Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.

Program(-y)

Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.

Temat(-y)

Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.

System finansowania

Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

BUDAPESTI MUSZAKI ES GAZDASAGTUDOMANYI EGYETEM
Wkład UE netto

Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.

€ 182 743,92
Koszt całkowity

Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.

Brak danych
Moja broszura 0 0