Skip to main content
Vai all'homepage della Commissione europea (si apre in una nuova finestra)
italiano italiano
CORDIS - Risultati della ricerca dell’UE
CORDIS

Development of a predictive quantum simulation protocol for understanding DNA polymerase function and toxic inhibition

Obiettivo

The phosphate chemistry of nucleoside triphosphates (NTPs) is at the heart of crucial biological processes including the cell’s energy storage, signalling and copying genetic information. Computational modelling valuably expands the spatiotemporal resolution of experimental structural biology, providing a key contribution to the synergistic understanding of such complex processes.
However, our preliminary results on phosphatase reactions shed light on the qualitative inaccuracy of the state-of-the-art methodology capable of free energy bio-simulations.

Thus, the candidate will be trained to extend the host’s uniquely accurate and efficient electronic structure approaches to the scale of enzyme simulations, producing thermodynamic properties comparable to experiments. The candidate brings complementary computational biochemistry experience and reaction mechanistic knowledge to this collaboration, demonstrated in his successful computational-experimental phosphate catalytic enzyme studies. Our concerted developments will combine methods from the forefront of quantum chemistry, high-performance computing, rare event molecular dynamics, and biochemical modelling into a widely applicable open-access protocol, with a predictive power currently limited to main-group homogeneous catalysis modelling.

The reliability of the reaction mechanisms predicted by the developed method will be validated against kinetic experiments on wild-type and mutant Ras GTPases, connected to ca. one third of the cancer cell lines. Then, we will utilise the established protocol to understand the (regular and faulty) binding and incorporation of deoxy-NTPs and nucleoside analogue drugs during mitochondrial DNA polymerisation to a yet unknown atomistic detail. These results will provide a foundation for a comprehensive kinetic model for DNA polymerase fidelity and for the future rational optimisation of more selective and less toxic antiretrovirals.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

È necessario effettuare l’accesso o registrarsi per utilizzare questa funzione

Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

BUDAPESTI MUSZAKI ES GAZDASAGTUDOMANYI EGYETEM
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 182 743,92
Indirizzo
MUEGYETEM RAKPART 3
1111 BUDAPEST
Ungheria

Mostra sulla mappa

Regione
Közép-Magyarország Budapest Budapest
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato
Il mio fascicolo 0 0