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Fast and comprehensive structure identification in cryo-ET using deep learning and tomogram optimisation

Ziel

Cryo-electron tomography (cryo-ET) revolutionises cellular structure visualisation, but extracting biological insights is often hindered by limitations of subtomogram averaging (STA). With AlphaFold2's recent breakthroughs in structure prediction, identifying known structures in their 3D cellular context is often more important than structure determination by STA. The TomoFind project aims to significantly improve our ability to identify biomolecular structures within tomographic reconstructions.

This goal will be pursued through three interconnected approaches: 1) Developing deep learning tools for rapid and comprehensive identification of known structures in tomograms; 2) Refining data acquisition parameters via mathematical modelling and computational optimisation; and 3) Enhancing reconstruction algorithms to fully leverage advancements from 1) and 2). This highly interdisciplinary project combines applied mathematics, machine learning, and structural biology, and close collaboration between computational and experimental groups ensures practical applicability and maximises chances of success.

TomoFind will advance cryo-ET analysis capabilities, enabling investigation of cellular structures and processes at unprecedented resolution and scale. The resulting open-source software will lead to high impact across structural and cell biology research communities.

The host institution's world-class technical expertise and state-of-the-art facilities provide an ideal environment for this project. This, combined with the applicant's interdisciplinary background spanning applied mathematics, data science, and computational imaging, forms a strong foundation, crucial for the success of TomoFind. The project will enhance the applicant's skills and network, boosting future prospects for prestigious European research positions. The host institute will also benefit from the project's outcomes, advancing its research capabilities in cryo-ET and structural biology.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

UNITED KINGDOM RESEARCH AND INNOVATION
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 260 347,92
Adresse
POLARIS HOUSE NORTH STAR AVENUE
SN2 1FL SWINDON
Vereinigtes Königreich

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Region
South West (England) Gloucestershire, Wiltshire and Bristol/Bath area Swindon
Aktivitätstyp
Research Organisations
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten
Mein Booklet 0 0