Descripción del proyecto
El papel de las interacciones entre bacteriófagos y bacterias en los mecanismos de defensa y contradefensa
Los conflictos genéticos entre hospedadores y microorganismos patógenos han dado forma a la inmunidad innata. Hallazgos recientes revelan que las defensas bacterianas contra los bacteriófagos comparten vínculos evolutivos con la inmunidad eucariota, lo que sugiere que el estudio de estas interacciones podría mejorar la comprensión de la dinámica hospedador-patógeno. En el proyecto CODA, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, se pretende identificar nuevos mecanismos de defensa y evasión, lo cual mejorará la comprensión de las interacciones hospedador-patógeno. El equipo del proyecto también identificará componentes de la inmunidad innata derivados de las defensas bacterianas y empleará bioinformática para predecir dominios proteicos que inducen la muerte de células inmunitarias en bacterias y que están conservados en eucariotas. Estos efectores se caracterizarán para diseñar nuevas proteínas inmunitarias en células humanas. Además, los investigadores del proyecto explorarán cómo los bacteriófagos y los virus que infectan células eucariotas evaden la inmunidad del hospedador utilizando técnicas de cribado de alto rendimiento.
Objetivo
Across the tree of life, genetic conflicts between hosts and pathogens have fueled the diversification of intracellular defenses that collectively define innate immunity. While prokaryotic and eukaryotic immunity have long been considered distinct, the recent discoveries of multiple defense systems protecting bacteria against viruses called phages have profoundly challenged this paradigm. In particular, some components of eukaryotic innate immunity were shown to have a deep evolutionary origin in bacterial defenses. The existence of ancient immune components suggests that phage-bacteria interactions can illuminate the genetic conflicts between hosts and pathogens across the tree of life, which I propose to explore through two angles.
Firstly, I propose to discover novel players of innate immunity based on bacterial defenses. A bioinformatic pipeline will systematically predict protein domains that trigger immune cell death in bacterial defenses and are conserved in eukaryotes. These effectors will be biochemically characterized in bacteria and beyond to unveil novel immune strategies disseminated across the tree of life. We will then exploit this evolutionary conservation to engineer novel immune proteins in human cells based on effectors found in other kingdoms of life.
Secondly, I hypothesize that phages and eukaryotic viruses in turn evolved similar strategies to evade immunity. We aim to discover new anti-defenses in phages and to translate them to the world of eukaryotic viruses. To do so, we will implement high-throughput screens to test the anti-defense activity of thousands of small phage genes. We will also conduct structural homology searches to reveal anti-defense mechanisms shared between phages and eukaryotic viruses and characterize them experimentally.
Altogether, this project will reveal novel molecular mechanisms of defense and anti-defense in bacteria and beyond, shedding light on the principles of host-pathogen interactions across the biosphere.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología bacteriología
- ciencias naturales ciencias biológicas biología evolutiva
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
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(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2025-STG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
75794 PARIS
Francia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.