Descrizione del progetto
Interazioni tra fagi e batteri nei meccanismi di difesa e anti-difesa
I conflitti genetici tra ospiti e agenti patogeni hanno modellato l’immunità innata. Recenti scoperte rivelano che le difese batteriche contro i fagi condividono legami evolutivi con l’immunità eucariotica, suggerendo che lo studio di queste interazioni può migliorare la nostra comprensione delle dinamiche ospite-patogeno. Il progetto CODA, finanziato dal CER, mira a identificare nuovi meccanismi di difesa ed elusione. Ciò consentirà di approfondire la nostra comprensione delle interazioni ospite-patogeno. Il progetto identificherà inoltre i componenti dell’immunità innata dalle difese batteriche e utilizzerà la bioinformatica per prevedere i domini proteici che inducono la morte delle cellule immunitarie nei batteri e sono conservati negli eucarioti. Questi effettori saranno caratterizzati per l’ingegnerizzazione di nuove proteine immunitarie nelle cellule umane. Il progetto esplorerà inoltre il modo in cui i fagi e i virus eucariotici eludono il sistema immunitario dell’ospite, utilizzando uno screening ad alta produttività.
Obiettivo
Across the tree of life, genetic conflicts between hosts and pathogens have fueled the diversification of intracellular defenses that collectively define innate immunity. While prokaryotic and eukaryotic immunity have long been considered distinct, the recent discoveries of multiple defense systems protecting bacteria against viruses called phages have profoundly challenged this paradigm. In particular, some components of eukaryotic innate immunity were shown to have a deep evolutionary origin in bacterial defenses. The existence of ancient immune components suggests that phage-bacteria interactions can illuminate the genetic conflicts between hosts and pathogens across the tree of life, which I propose to explore through two angles.
Firstly, I propose to discover novel players of innate immunity based on bacterial defenses. A bioinformatic pipeline will systematically predict protein domains that trigger immune cell death in bacterial defenses and are conserved in eukaryotes. These effectors will be biochemically characterized in bacteria and beyond to unveil novel immune strategies disseminated across the tree of life. We will then exploit this evolutionary conservation to engineer novel immune proteins in human cells based on effectors found in other kingdoms of life.
Secondly, I hypothesize that phages and eukaryotic viruses in turn evolved similar strategies to evade immunity. We aim to discover new anti-defenses in phages and to translate them to the world of eukaryotic viruses. To do so, we will implement high-throughput screens to test the anti-defense activity of thousands of small phage genes. We will also conduct structural homology searches to reveal anti-defense mechanisms shared between phages and eukaryotic viruses and characterize them experimentally.
Altogether, this project will reveal novel molecular mechanisms of defense and anti-defense in bacteria and beyond, shedding light on the principles of host-pathogen interactions across the biosphere.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche microbiologia batteriologia
- scienze naturali scienze biologiche biologia evoluzionistica
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2025-STG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
75794 PARIS
Francia
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.