Description du projet
Les interactions phages–bactéries pour les mécanismes de défense et d’anti-défense
Les conflits génétiques entre les hôtes et les agents pathogènes ont façonné l’immunité innée. Des découvertes récentes révèlent que les défenses bactériennes contre les phages partagent des liens évolutifs avec l’immunité eucaryote, ce qui suggère que l’étude de ces interactions peut approfondir nos connaissances sur la dynamique hôte–agent pathogène. Le projet CODA, financé par le CER, vise à identifier de nouveaux mécanismes de défense et d’évasion, ce qui nous permettra de mieux comprendre les interactions entre l’hôte et l’agent pathogène. Il identifiera également les composants de l’immunité innée à partir des défenses bactériennes et utilisera la bio-informatique pour prédire les domaines protéiques qui induisent la mort des cellules immunitaires chez les bactéries et qui sont conservés chez les eucaryotes. Ces effecteurs seront caractérisés pour l’ingénierie de nouvelles protéines immunitaires dans les cellules humaines. En outre, le projet examinera comment les phages et les virus eucaryotes échappent à l’immunité de l’hôte, à l’aide d’un criblage à haut débit.
Objectif
Across the tree of life, genetic conflicts between hosts and pathogens have fueled the diversification of intracellular defenses that collectively define innate immunity. While prokaryotic and eukaryotic immunity have long been considered distinct, the recent discoveries of multiple defense systems protecting bacteria against viruses called phages have profoundly challenged this paradigm. In particular, some components of eukaryotic innate immunity were shown to have a deep evolutionary origin in bacterial defenses. The existence of ancient immune components suggests that phage-bacteria interactions can illuminate the genetic conflicts between hosts and pathogens across the tree of life, which I propose to explore through two angles.
Firstly, I propose to discover novel players of innate immunity based on bacterial defenses. A bioinformatic pipeline will systematically predict protein domains that trigger immune cell death in bacterial defenses and are conserved in eukaryotes. These effectors will be biochemically characterized in bacteria and beyond to unveil novel immune strategies disseminated across the tree of life. We will then exploit this evolutionary conservation to engineer novel immune proteins in human cells based on effectors found in other kingdoms of life.
Secondly, I hypothesize that phages and eukaryotic viruses in turn evolved similar strategies to evade immunity. We aim to discover new anti-defenses in phages and to translate them to the world of eukaryotic viruses. To do so, we will implement high-throughput screens to test the anti-defense activity of thousands of small phage genes. We will also conduct structural homology searches to reveal anti-defense mechanisms shared between phages and eukaryotic viruses and characterize them experimentally.
Altogether, this project will reveal novel molecular mechanisms of defense and anti-defense in bacteria and beyond, shedding light on the principles of host-pathogen interactions across the biosphere.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques biologie de l'évolution
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2025-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
75794 PARIS
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.