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Deconvolution of tumor evolution and ecosystem through EV-based liquid biopsy

Descrizione del progetto

Biopsia liquida per cogliere la complessità del cancro

Il microambiente tumorale svolge un ruolo centrale nello sviluppo e nella progressione tumorali, oltre che nella resistenza ai trattamenti. Tracciare il modo in cui i tumori e l’ecosistema circostante si evolvono durante il trattamento è essenziale per personalizzare la terapia oncologica. Ma le biopsie liquide colgono solo i cambiamenti tumore-specifici. Per ovviare a questa limitazione, il progetto EVOLVE, finanziato dal CER, si basa su una piattaforma innovativa di profilazione dell’RNA in grado di distinguere i segnali molecolari specifici del tumore da cambiamenti più ampi che si presentano nel microambiente. Analizzando l’RNA trasportato in minuscole vescicole legate alla membrana e rilasciate nel flusso sanguigno, i ricercatori decodificheranno il modo in cui i tumori e gli ecosistemi immunitari e stromali circostanti si adattano al trattamento. Questi approfondimenti consentiranno un monitoraggio più accurato della malattia e orienteranno lo sviluppo di strategie terapeutiche personalizzate per i pazienti oncologici.

Obiettivo

Cancer progression and drug resistance are driven not only by tumor-intrinsic factors but also by complex interactions between tumor cells and their evolving microenvironment. Understanding the longitudinal co-evolution of tumors and their microenvironment is critical for developing personalized therapeutic strategies, including optimizing immunotherapeutic approaches.
Liquid biopsies provide a minimally invasive approach for longitudinal monitoring of cancer dynamics. Current methods primarily focus on next-generation sequencing-based analysis of circulating tumor DNA (ctDNA) or circulating tumor cells (CTCs), which track only tumor-specific changes during disease progression. However, other sources, such as extracellular vesicle RNA (EV-RNA) profiling, can capture broader transcriptomic changes in response to therapy. This capability is exemplified by our RExCuE (mRNA Expression in Circulating EVs) platform, an innovative tool that monitors mRNA alterations in circulation. However, RExCuE is currently unable to distinguish tumor-specific changes from systemic effects. To address this gap, I will build upon my expertise in EV-RNA analysis to understand tumor-intrinsic pathways and the activation status of tumor-extrinsic factors, including the tumor stroma and immune ecosystem. In particularly, I will: (1) identify tumor-specific EV-RNA alterations associated with therapy response and disease progression; (2) characterize the impact of ecosystem-derived EVs on tumor evolution and therapy outcomes; and (3) develop a comprehensive tool to deconvolute tumor-intrinsic and extrinsic transcriptomic changes from clinical samples in circulation.
This approach intends to provide a deeper understanding of the adaptive responses of both tumors and their ecosystems to treatments, ultimately guiding more effective and personalized therapeutic strategies.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

Parole chiave

Programma(i)

Argomento(i)

Meccanismo di finanziamento

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

(si apre in una nuova finestra) ERC-2025-STG

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Istituzione ospitante

FUNDACION DE LA COMUNIDAD VALENCIANA CENTRO DE INVESTIGACION PRINCIPE FELIPE
Contributo netto dell'UE
€ 1 987 583,00
Indirizzo
CALLE EDUARDO PRIMO YUFERA 3
46012 Valencia
Spagna
Regione
Este Comunitat Valenciana Valencia/València
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale
€ 1 987 583,00

Beneficiari (1)