Skip to main content
Aller à la page d’accueil de la Commission européenne (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)
français fr
CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
CORDIS

Unraveling the network that controls the fate of RNA Polymerase II during early elongation.

Description du projet

La prise de décision lors de la synthèse de l’ARN

L’ARN messager ou ARNm joue le rôle d’intermédiaire dans la cellule, transportant les instructions génétiques qui sont traduites en protéines. La synthèse de l’ARNm est étroitement régulée à plusieurs niveaux: initiation, traitement et terminaison précoce de la transcription, qui s’est révélée être un point de contrôle réglementaire critique pouvant interrompre prématurément la synthèse de l’ARNm. En même temps, la terminaison précoce est un moyen de contrôler la transcription des ARN non codants. Le projet STOP-OR-GO, financé par le CER, vise à délimiter ce processus de décision et à découvrir comment les cellules déterminent si la transcription doit se poursuivre sur de longues distances ou se terminer prématurément. Les chercheurs utiliseront une nouvelle méthodologie pour identifier les éléments de séquence et les facteurs protéiques qui régulent cet équilibre. La compréhension de ces principes permettra non seulement d’élucider une couche fondamentale de la régulation des gènes, mais aussi d’optimiser la conception des transgènes pour les applications de thérapie génique.

Objectif

The repertoire of messenger RNAs (mRNAs) in a cell dictates cell identity and function. Therefore, mRNA expression is tightly controlled. A previously underappreciated regulatory step is early transcription termination, which can abort the synthesis of full-length mRNAs. The early termination of many non-coding RNAs prevents transcriptional interference and genomic instability. Thus, cells need to correctly balance early termination and productive elongation at both coding and non-coding loci. Why elongation is favoured at some loci, and termination at others, is poorly understood.
To understand how the balance between elongation and termination is achieved, we need to know what sequence elements and proteins are involved, and how they work together. These regulatory sequences and proteins have not been systematically identified. Using INSERT-seq, I have identified novel candidate regulators that I will study here in more detail. The same reporter setup will be adapted to identify novel trans-acting regulators of the elongation/termination balance. These approaches act synergistically to uncover the network of regulators. I will then apply a combination of unbiased and hypothesis-driven experiments to understand the mechanisms of regulation. We will also focus on understanding how early termination is promoted by ZC3H4 (Restrictor), a recently identified suppressor of non-coding RNAs. The work proposed here will uncover the principles that decide if transcription of a locus will terminate early, an essential step towards fully understanding transcription regulation. Knowing the sequence and protein regulators that determine the fate of early elongating RNAPII will open opportunities to study how disease mutations affect their function. Moreover, understanding the control of this elongation/termination balance will also provide us with tools to manipulate this balance. This will improve our ability to design sequences for optimal transgene expression in gene therapy.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

Mots‑clés

Programme(s)

Thème(s)

Régime de financement

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2025-STG

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Institution d’accueil

UNIVERSITEIT UTRECHT
Contribution nette de l'UE
€ 1 500 000,00
Coût total
€ 1 500 000,00

Bénéficiaires (1)