Projektbeschreibung
Entscheidungsfindung während der RNA-Synthese
Messenger RNA bzw. mRNA fungiert als Vermittler der Zelle und trägt genetische Anweisungen in sich, die in Proteine übersetzt werden. Die mRNA-Synthese wird auf mehreren Ebenen streng reguliert: bei der Initiierung, Verarbeitung und frühzeitigen Beendigung der Transkription, die sich als kritischer Kontrollpunkt erwiesen hat, an dem die mRNA-Synthese vorzeitig abgebrochen werden kann. Gleichzeitig ist der frühzeitige Abbruch eine Möglichkeit, die Transkription von nichtcodierender RNA in Schach zu halten. Das ERC-finanzierte Projekt STOP-OR-GO will diesen Entscheidungsprozess beschreiben und aufdecken, wie Zellen entscheiden, ob die Transkription über lange Strecken fortgesetzt oder vorzeitig beendet wird. Die Forschenden werden eine neue Methode anwenden, um die Sequenzelemente und Proteinfaktoren zu identifizieren, die dieses Gleichgewicht regulieren. Das Verständnis dieser Prinzipien wird nicht nur eine Grundlage der Genregulation aufklären, sondern auch zur Optimierung des Designs von Transgenen für gentherapeutische Anwendungen beitragen.
Ziel
The repertoire of messenger RNAs (mRNAs) in a cell dictates cell identity and function. Therefore, mRNA expression is tightly controlled. A previously underappreciated regulatory step is early transcription termination, which can abort the synthesis of full-length mRNAs. The early termination of many non-coding RNAs prevents transcriptional interference and genomic instability. Thus, cells need to correctly balance early termination and productive elongation at both coding and non-coding loci. Why elongation is favoured at some loci, and termination at others, is poorly understood.
To understand how the balance between elongation and termination is achieved, we need to know what sequence elements and proteins are involved, and how they work together. These regulatory sequences and proteins have not been systematically identified. Using INSERT-seq, I have identified novel candidate regulators that I will study here in more detail. The same reporter setup will be adapted to identify novel trans-acting regulators of the elongation/termination balance. These approaches act synergistically to uncover the network of regulators. I will then apply a combination of unbiased and hypothesis-driven experiments to understand the mechanisms of regulation. We will also focus on understanding how early termination is promoted by ZC3H4 (Restrictor), a recently identified suppressor of non-coding RNAs. The work proposed here will uncover the principles that decide if transcription of a locus will terminate early, an essential step towards fully understanding transcription regulation. Knowing the sequence and protein regulators that determine the fate of early elongating RNAPII will open opportunities to study how disease mutations affect their function. Moreover, understanding the control of this elongation/termination balance will also provide us with tools to manipulate this balance. This will improve our ability to design sequences for optimal transgene expression in gene therapy.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
Die Klassifikation dieses Projekts wurde von Menschen validiert.
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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(öffnet in neuem Fenster) ERC-2025-STG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
3584 CS Utrecht
Niederlande
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.