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Spatiotemporal models of tissue patterning and cellular commitment during embryonic development

Obiettivo

One of the most remarkable processes in biology is how animals develop from a single fertilized egg within a short time of rapid growth and an explosion in spatial and cellular diversity. Embryonic development is highly deterministic and consistent among different embryos and conserved across species. Astonishingly, embryos reuse the same signaling pathways in diverse developmental contexts to robustly pattern tissues. The advent of single-cell genomics in the last decade has allowed to chart the phenomenology of cellular differentiation at unprecedented resolution and scale. Yet, moving from such single-cell descriptions to models of how embryonic tissues achieve robustness and precision in their differentiation remains exceedingly difficult.

To this end, we will develop new algorithms that will infer the spatiotemporal dynamics of differentiating tissues from space-, time- and lineage-resolved data. Tissues will be modelled as groups of proliferating and interacting cells distributed in space and moving along transcriptional, epigenetic and signaling manifolds. Focusing on the developmental stages of gastrulation and early organogenesis, we will reconstruct the spatiotemporal trajectories of cells together with the dynamics of their local niches. These trajectories will serve as the input to mathematical models that will predict local changes in a cell’s state from its signalome, epigenome and transcription factor repertoire. Using zebrafish embryos as a high-throughput system of vertebrate development, we will systematically test these models through time-dependent, combinatorial perturbations with a multiomic read-out. My overall goal is to develop quantitative, data-based models of how transcriptional, epigenetic and intercellular changes at the cellular level translate into robust and deterministic dynamics at the tissue level and to apply these methods to dissect how positional information and cell fate commitment emerges in the vertebrate embryo.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) ERC-2025-STG

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Istituzione ospitante

MAX DELBRUECK CENTRUM FUER MOLEKULARE MEDIZIN IN DER HELMHOLTZ-GEMEINSCHAFT (MDC)
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 1 498 683,00
Indirizzo
ROBERT ROSSLE STRASSE 10
13125 Berlin
Germania

Mostra sulla mappa

Regione
Berlin Berlin Berlin
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 1 498 683,00

Beneficiari (1)

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