Opis projektu
Modelowanie procesu kształtowania tkanek w zarodkach
Zwierzęta rozwijają się z pojedynczego zapłodnionego jaja w złożone organizmy poprzez dobrze zachowane procesy embrionalne. Chociaż genomika pojedynczych komórek oferuje wgląd w różnicowanie komórkowe, wyzwaniem pozostaje stworzenie modeli, które tłumaczyłyby tę odporność. Finansowany przez ERBN projekt EmbryoAxes opracuje algorytmy do analizy dynamiki różnicujących się tkanek przy użyciu danych przestrzennych, czasowych i związanych z pochodzeniem. Modelując tkanki jako grupy współdziałających komórek, które podążają ścieżkami transkrypcyjnymi, epigenetycznymi i sygnalizacyjnymi, projekt odtworzy trajektorie komórek w czasie gastrulacji i wczesnej organogenezy. Trajektorie te będą posłużą jako źródło informacji, na których zbudowane zostaną modele przewidujące zmiany stanu komórki w oparciu o różne czynniki molekularne. Wykorzystując zarodki danio pręgowanego do badań o wysokiej przepustowości, zespół projektu będzie systematycznie testować te modele poprzez kombinatoryczne perturbacje i analizę wieloomiczną.
Cel
One of the most remarkable processes in biology is how animals develop from a single fertilized egg within a short time of rapid growth and an explosion in spatial and cellular diversity. Embryonic development is highly deterministic and consistent among different embryos and conserved across species. Astonishingly, embryos reuse the same signaling pathways in diverse developmental contexts to robustly pattern tissues. The advent of single-cell genomics in the last decade has allowed to chart the phenomenology of cellular differentiation at unprecedented resolution and scale. Yet, moving from such single-cell descriptions to models of how embryonic tissues achieve robustness and precision in their differentiation remains exceedingly difficult.
To this end, we will develop new algorithms that will infer the spatiotemporal dynamics of differentiating tissues from space-, time- and lineage-resolved data. Tissues will be modelled as groups of proliferating and interacting cells distributed in space and moving along transcriptional, epigenetic and signaling manifolds. Focusing on the developmental stages of gastrulation and early organogenesis, we will reconstruct the spatiotemporal trajectories of cells together with the dynamics of their local niches. These trajectories will serve as the input to mathematical models that will predict local changes in a cell’s state from its signalome, epigenome and transcription factor repertoire. Using zebrafish embryos as a high-throughput system of vertebrate development, we will systematically test these models through time-dependent, combinatorial perturbations with a multiomic read-out. My overall goal is to develop quantitative, data-based models of how transcriptional, epigenetic and intercellular changes at the cellular level translate into robust and deterministic dynamics at the tissue level and to apply these methods to dissect how positional information and cell fate commitment emerges in the vertebrate embryo.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka epigenetyka epigenomy
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna embriologia
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2025-STG
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
13125 Berlin
Niemcy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.