Descripción del proyecto
Exploración de la regulación de transposones en plantas
Los transposones son secuencias de ADN que se desplazan dentro de los genomas, lo que contribuye a la variabilidad genética y a la evolución. Sin embargo, aún no se conocen bien sus mecanismos reguladores. El equipo del proyecto MOBICODE, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, explorará la regulación de los transposones en las plantas mediante un método de detección que permite el seguimiento al instante del movimiento de los transposones en una sola célula, lo que mejorará nuestra comprensión de la regulación de la transposición. En el proyecto se validará la hipótesis de que la transposición es más frecuente en los tejidos somáticos utilizando la secuenciación de ARN unicelular. A continuación, se identificarán nuevos reguladores de la transposición con un cribado CRISPR de todo el genoma junto con RUM. Por último, se explorarán los motivos reguladores internos de los transposones mediante la cartografía de puntos calientes de mutación. Esta investigación pretende aclarar las complejas redes que controlan el movimiento de los transposones.
Objetivo
Transposons are ubiquitous DNAs capable of changing their genomic locations. While historically perceived as detrimental and damaging to host genomes, they have also been a major source of genetic variability, driving evolution. Unfortunately, the regulatory mechanisms of transposons remain largely unknown, primarily due to the lack of experimental methods to trace their movement. This project therefore aims to dissect the regulation of transposons in plants with unprecedented detail. This goal is enabled by a distinctive method developed in my lab, RUM (Real-time detection of transposon jUMping). RUM provides real-time, single-cell detection of transposon movement, offering a powerful platform to unravel the complexities of transposition regulation. Specifically, this project will focus on three major objectives investigating at multiple scales, from tissue to cellular and molecular levels. Firstly, it has long been assumed that transposition occurs more frequently in somatic tissues, however, this assumption has yet to be empirically validated. To comprehensively evaluate cell type-specific transposition activity, I will integrate RUM with single-cell RNA sequencing. This approach will provide a detailed map of cellular competence for transposition. Secondly, while epigenetic silencing is well known as a mechanism controlling transposons, significant gaps remain in our understanding of post-transcriptional and pre-integrational regulation. To identify novel regulators of transposition, I will perform a custom genome-wide CRISPR screen in combination with RUM. Thirdly, internal and auto-regulatory sequence motifs within transposons remain poorly studied. To address this, I will generate random mutations within RUM and map mutation hotspots associated with active transposition. Altogether, this study will illuminate the complex regulatory networks governing transposon movement, bridging longstanding knowledge gaps in biology.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN transcriptomas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética mutación
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2025-COG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
DH1 3LE DURHAM
Reino Unido
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.