Description du projet
Étudier la régulation des transposons chez les plantes
Les transposons sont des séquences d’ADN qui se déplacent au sein des génomes, contribuant ainsi à la variabilité génétique et à l’évolution. Leurs mécanismes de régulation restent toutefois mal compris. Le projet MOBICODE, financé par le CER, étudiera la régulation des transposons dans les plantes à l’aide d’une méthode de détection qui permet de surveiller en temps réel le mouvement des transposons dans une seule cellule, améliorant ainsi notre compréhension de la régulation de la transposition. Il validera l’hypothèse selon laquelle la transposition est plus fréquente dans les tissus somatiques en utilisant le séquençage de l’ARN d’une seule cellule. Il identifiera ensuite de nouveaux régulateurs de la transposition grâce à un criblage CRISPR à l’échelle du génome, parallèlement au RUM. Enfin, il explorera les motifs de régulation interne des transposons en cartographiant les zones sensibles aux mutations. Ces travaux visent à clarifier les réseaux complexes qui contrôlent le mouvement des transposons.
Objectif
Transposons are ubiquitous DNAs capable of changing their genomic locations. While historically perceived as detrimental and damaging to host genomes, they have also been a major source of genetic variability, driving evolution. Unfortunately, the regulatory mechanisms of transposons remain largely unknown, primarily due to the lack of experimental methods to trace their movement. This project therefore aims to dissect the regulation of transposons in plants with unprecedented detail. This goal is enabled by a distinctive method developed in my lab, RUM (Real-time detection of transposon jUMping). RUM provides real-time, single-cell detection of transposon movement, offering a powerful platform to unravel the complexities of transposition regulation. Specifically, this project will focus on three major objectives investigating at multiple scales, from tissue to cellular and molecular levels. Firstly, it has long been assumed that transposition occurs more frequently in somatic tissues, however, this assumption has yet to be empirically validated. To comprehensively evaluate cell type-specific transposition activity, I will integrate RUM with single-cell RNA sequencing. This approach will provide a detailed map of cellular competence for transposition. Secondly, while epigenetic silencing is well known as a mechanism controlling transposons, significant gaps remain in our understanding of post-transcriptional and pre-integrational regulation. To identify novel regulators of transposition, I will perform a custom genome-wide CRISPR screen in combination with RUM. Thirdly, internal and auto-regulatory sequence motifs within transposons remain poorly studied. To address this, I will generate random mutations within RUM and map mutation hotspots associated with active transposition. Altogether, this study will illuminate the complex regulatory networks governing transposon movement, bridging longstanding knowledge gaps in biology.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN transcriptomes
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2025-COG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
DH1 3LE DURHAM
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.