Opis projektu
Badania regulacji transpozonów w roślinach
Transpozony to sekwencje DNA, które przemieszczają się w genomach, i są przyczyną zmienności genetycznej oraz ewolucji. Ich mechanizmy regulacyjne pozostają jednak słabo poznane. Zespół finansowanego ze środków Europejskiej Rady ds. Badań Naukowych projektu MOBICODE zbada regulację transpozonów w roślinach przy użyciu metody wykrywania, która umożliwia jednokomórkowe monitorowanie ruchu transpozonów w czasie rzeczywistym, poprawiając nasze zrozumienie regulacji transpozycji. Zespół zweryfikuje założenie, według którego transpozycja jest częstsza w tkankach somatycznych, przy użyciu sekwencjonowania RNA pojedynczych komórek. Badacze wskażą także nowe regulatory transpozycji za pomocą badań przesiewowych CRISPR całego genomu połączone z RUM. Ponadto zespół zbada wewnętrzne motywy regulacyjne w transpozonach poprzez mapowanie centrów mutacji. Badania mają na celu wyjaśnienie złożonych sieci, które wpływają na ruch transpozonów.
Cel
Transposons are ubiquitous DNAs capable of changing their genomic locations. While historically perceived as detrimental and damaging to host genomes, they have also been a major source of genetic variability, driving evolution. Unfortunately, the regulatory mechanisms of transposons remain largely unknown, primarily due to the lack of experimental methods to trace their movement. This project therefore aims to dissect the regulation of transposons in plants with unprecedented detail. This goal is enabled by a distinctive method developed in my lab, RUM (Real-time detection of transposon jUMping). RUM provides real-time, single-cell detection of transposon movement, offering a powerful platform to unravel the complexities of transposition regulation. Specifically, this project will focus on three major objectives investigating at multiple scales, from tissue to cellular and molecular levels. Firstly, it has long been assumed that transposition occurs more frequently in somatic tissues, however, this assumption has yet to be empirically validated. To comprehensively evaluate cell type-specific transposition activity, I will integrate RUM with single-cell RNA sequencing. This approach will provide a detailed map of cellular competence for transposition. Secondly, while epigenetic silencing is well known as a mechanism controlling transposons, significant gaps remain in our understanding of post-transcriptional and pre-integrational regulation. To identify novel regulators of transposition, I will perform a custom genome-wide CRISPR screen in combination with RUM. Thirdly, internal and auto-regulatory sequence motifs within transposons remain poorly studied. To address this, I will generate random mutations within RUM and map mutation hotspots associated with active transposition. Altogether, this study will illuminate the complex regulatory networks governing transposon movement, bridging longstanding knowledge gaps in biology.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka DNA
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka RNA transkryptomy
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka mutacja
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2025-COG
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
DH1 3LE DURHAM
Zjednoczone Królestwo
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.