Descrizione del progetto
Esplorare la regolazione dei trasposoni nelle piante
I trasposoni sono sequenze di DNA che si spostano all’interno dei genomi, contribuendo alla variabilità genetica e all’evoluzione; ciononostante, i loro meccanismi di regolazione sono ancora poco conosciuti. Il progetto MOBICODE, finanziato dal CER, esplorerà la regolazione dei trasposoni nelle piante utilizzando un metodo di rilevamento che consente di monitorarne in tempo reale il movimento in una singola cellula, migliorando la nostra comprensione della regolazione della trasposizione. Il progetto convaliderà l’ipotesi secondo cui la trasposizione sarebbe più frequente nei tessuti somatici utilizzando il sequenziamento dell’RNA di una singola cellula, per poi individuare nuovi regolatori della trasposizione con uno screening CRISPR dell’intero genoma insieme a RUM. Infine, esplorerà i motivi regolatori interni dei trasposoni mappando gli hotspot di mutazione, nell’ambito di una ricerca volta a chiarire le complesse reti che controllano il movimento dei trasposoni.
Obiettivo
Transposons are ubiquitous DNAs capable of changing their genomic locations. While historically perceived as detrimental and damaging to host genomes, they have also been a major source of genetic variability, driving evolution. Unfortunately, the regulatory mechanisms of transposons remain largely unknown, primarily due to the lack of experimental methods to trace their movement. This project therefore aims to dissect the regulation of transposons in plants with unprecedented detail. This goal is enabled by a distinctive method developed in my lab, RUM (Real-time detection of transposon jUMping). RUM provides real-time, single-cell detection of transposon movement, offering a powerful platform to unravel the complexities of transposition regulation. Specifically, this project will focus on three major objectives investigating at multiple scales, from tissue to cellular and molecular levels. Firstly, it has long been assumed that transposition occurs more frequently in somatic tissues, however, this assumption has yet to be empirically validated. To comprehensively evaluate cell type-specific transposition activity, I will integrate RUM with single-cell RNA sequencing. This approach will provide a detailed map of cellular competence for transposition. Secondly, while epigenetic silencing is well known as a mechanism controlling transposons, significant gaps remain in our understanding of post-transcriptional and pre-integrational regulation. To identify novel regulators of transposition, I will perform a custom genome-wide CRISPR screen in combination with RUM. Thirdly, internal and auto-regulatory sequence motifs within transposons remain poorly studied. To address this, I will generate random mutations within RUM and map mutation hotspots associated with active transposition. Altogether, this study will illuminate the complex regulatory networks governing transposon movement, bridging longstanding knowledge gaps in biology.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA trascrittomi
- scienze naturali scienze biologiche genetica mutazione
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
È necessario effettuare l’accesso o registrarsi per utilizzare questa funzione
Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo programma
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2025-COG
Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bandoIstituzione ospitante
Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
DH1 3LE DURHAM
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.