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Mining the ubiquitin system for catalytic activities through advanced ubiquitin probes

Obiettivo

I propose a chemoproteomic platform for the discovery of unchartered eraser activities regulating post-translational modifications within the ubiquitin system. This approach will be enabled by a suite of advanced ubiquitin probes. These reagents recapitulate the complexity of cellular polyubiquitin modifications and are equipped with novel electrophilic handles to report on polyubiquitin chain length- and linkage-dependent activities of deubiquitinating enzymes. These enzymes reverse ubiquitin modifications and critically determine the outcome of ubiquitin-mediated signalling, yet how they decode ubiquitin chains has remained poorly understood. Moreover, activity-based probes with novel designs will enable chemoproteomic experiments to identify enzymes with novel catalytic mechanisms and with relevance in cellular stress response processes. These insights will subsequently reveal molecular mechanisms of chain-length decoding and substrate recognition by facilitating the structural analysis of DUB-probe complexes. Taken together, the proposed work breaks new ground through a rational workflow for comprehensively mining the proteome for unprecedented DUB/Ubl eraser activities. Expected results will have broad implications also for ubiquitin assembly enzymes, pathogen-derived virulence factors and other protein classes. UbiPRO will thus illuminate a fundamentally important and evolutionarily conserved system of molecular information encoding employed by all forms of life.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) ERC-2025-COG

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Istituzione ospitante

UNIVERSITAET DUISBURG-ESSEN
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 1 999 721,00
Indirizzo
UNIVERSITATSSTRASSE 2
45141 ESSEN
Germania

Mostra sulla mappa

Regione
Nordrhein-Westfalen Düsseldorf Essen, Kreisfreie Stadt
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 1 999 721,00

Beneficiari (2)

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