Objectif
Cell-autonomous innate immunity is the first line of defense against pathogens and is crucial in infections, viral cross-species transmissions and autoimmunity. In mammals, it is notably composed of proteins from the interferon pathway inhibiting viruses within infected cells. In turn, viruses evade or antagonize immunity, leading to virus-host evolutionary arms-races. Beyond classic adaptation by site-specific positive selection, we discovered cases of gene duplications with divergence in gene expression and sequence, including by protein domain rearrangements, that appear adaptive in Myotis bats. I thus hypothesize that recurrent gene duplications and domain rearrangements represent overlooked biological principles in the diversification of mammalian innate immunity, enabling hosts to keep up against rapidly evolving viruses. I further hypothesize that we can use these evolutionary cues to distinctively discover novel innate immune genes.
FUNEVO bridges the fields of evolutionary biology and antiviral innate immunology to decipher conceptual novelties on the evolutionary rules governing mammalian immunity.
Aim 1 combines phylogenomics, with state-of-the-art CRISPR loss-of-function and homologs’ gain-of-function antiviral screens, in the Myotis cross-discipline model platform that we newly established, to discover immune innovations driving antiviral specificity. In Aim 2, we use recent breakthroughs in genomics and protein domain structure predictions to identify and quantify immune innovations during mammalian evolution. In Aim 3, through ancestral reconstructions combined with mechanistic characterization, we will understand how the identified gene duplications and domain rearrangements led to functional novelty.
Overall, our evolution-guided approach will unveil novel antiviral genes that emerged in mammals, shedding lights on the evolutionary principles that were crucial to innate immune evolution and have the potential to inspire future disease therapy.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques biologie de l'évolution
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale immunologie
- sciences naturelles sciences biologiques zoologie mammalogie
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
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HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2025-COG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
75794 PARIS
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.