Objetivo
FEMTOMICS is redefining analytical chemistry by introducing the first femtosecond-based platform for proteome-wide decoding of dynamic DNA–protein interactions in cells. Capturing weak and transient interactions in intact cells remains a key challenge in measurement science. Chemical cross-linking is slow, perturbs cellular equilibrium, and has limited specificity, while UV irradiation is inefficient, damaging, and fails to stabilise fleeting contacts. Current methods detect abundant interactions, such as histones, but cannot resolve many transcription factors or other DNA-binding proteins whose short-lived bindings are essential for gene regulation. Moreover, genomic, proteomic, and structural layers are typically studied in isolation, overlooking integration.
FEMTOMICS closes these gaps with a paradigm-shifting platform that integrates femtosecond laser cross-linking (fliX) with high-resolution mass spectrometry (fliX–MS) and nanopore sequencing (fliX–NPS). With sub-ps, fliX enables zero-length cross-linking of DNA–protein interactions while preserving DNA integrity. fliX–MS provides proteome-wide detection of DNA-bound proteins at atomic resolution, and fliX–NPS pinpoints binding sites at single-nucleotide resolution with matched transcriptome and methylation profiles; all datasets are integrated through advanced bioinformatics for structural and functional analysis. These modules yield time-resolved, multimodal maps of transient DNA–protein complexes in situ.
By benchmarking against established methods, FEMTOMICS will demonstrate measurable gains in temporal resolution, specificity, and coverage, expanding detection from histones to rare transcription factors. The resulting datasets will reconstruct networks, generate hypotheses, and resolve regulatory states. As proof of concept, the platform will be validated in breast cancer cell models, demonstrating how photonics, sequencing, and data science set new standards in chemistry and medicine.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales informática y ciencias de la información ciencia de datos
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN transcriptomas
- ciencias naturales ciencias físicas óptica física del láser
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2025-ADG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
31134 Hildesheim
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.