Obiettivo
FEMTOMICS is redefining analytical chemistry by introducing the first femtosecond-based platform for proteome-wide decoding of dynamic DNA–protein interactions in cells. Capturing weak and transient interactions in intact cells remains a key challenge in measurement science. Chemical cross-linking is slow, perturbs cellular equilibrium, and has limited specificity, while UV irradiation is inefficient, damaging, and fails to stabilise fleeting contacts. Current methods detect abundant interactions, such as histones, but cannot resolve many transcription factors or other DNA-binding proteins whose short-lived bindings are essential for gene regulation. Moreover, genomic, proteomic, and structural layers are typically studied in isolation, overlooking integration.
FEMTOMICS closes these gaps with a paradigm-shifting platform that integrates femtosecond laser cross-linking (fliX) with high-resolution mass spectrometry (fliX–MS) and nanopore sequencing (fliX–NPS). With sub-ps, fliX enables zero-length cross-linking of DNA–protein interactions while preserving DNA integrity. fliX–MS provides proteome-wide detection of DNA-bound proteins at atomic resolution, and fliX–NPS pinpoints binding sites at single-nucleotide resolution with matched transcriptome and methylation profiles; all datasets are integrated through advanced bioinformatics for structural and functional analysis. These modules yield time-resolved, multimodal maps of transient DNA–protein complexes in situ.
By benchmarking against established methods, FEMTOMICS will demonstrate measurable gains in temporal resolution, specificity, and coverage, expanding detection from histones to rare transcription factors. The resulting datasets will reconstruct networks, generate hypotheses, and resolve regulatory states. As proof of concept, the platform will be validated in breast cancer cell models, demonstrating how photonics, sequencing, and data science set new standards in chemistry and medicine.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali informatica e scienze dell'informazione scienza dei dati
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2025-ADG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
31134 Hildesheim
Germania
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.