Objectif
FEMTOMICS is redefining analytical chemistry by introducing the first femtosecond-based platform for proteome-wide decoding of dynamic DNA–protein interactions in cells. Capturing weak and transient interactions in intact cells remains a key challenge in measurement science. Chemical cross-linking is slow, perturbs cellular equilibrium, and has limited specificity, while UV irradiation is inefficient, damaging, and fails to stabilise fleeting contacts. Current methods detect abundant interactions, such as histones, but cannot resolve many transcription factors or other DNA-binding proteins whose short-lived bindings are essential for gene regulation. Moreover, genomic, proteomic, and structural layers are typically studied in isolation, overlooking integration.
FEMTOMICS closes these gaps with a paradigm-shifting platform that integrates femtosecond laser cross-linking (fliX) with high-resolution mass spectrometry (fliX–MS) and nanopore sequencing (fliX–NPS). With sub-ps, fliX enables zero-length cross-linking of DNA–protein interactions while preserving DNA integrity. fliX–MS provides proteome-wide detection of DNA-bound proteins at atomic resolution, and fliX–NPS pinpoints binding sites at single-nucleotide resolution with matched transcriptome and methylation profiles; all datasets are integrated through advanced bioinformatics for structural and functional analysis. These modules yield time-resolved, multimodal maps of transient DNA–protein complexes in situ.
By benchmarking against established methods, FEMTOMICS will demonstrate measurable gains in temporal resolution, specificity, and coverage, expanding detection from histones to rare transcription factors. The resulting datasets will reconstruct networks, generate hypotheses, and resolve regulatory states. As proof of concept, the platform will be validated in breast cancer cell models, demonstrating how photonics, sequencing, and data science set new standards in chemistry and medicine.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles informatique et science de l'information science des données
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN transcriptomes
- sciences naturelles mathématiques mathématiques pures analyse mathématique analyse fonctionnelle
- sciences naturelles sciences chimiques chimie analytique spectrométrie de masse
- sciences naturelles sciences physiques optique physique des lasers
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2025-ADG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
31134 Hildesheim
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.