Projektbeschreibung
Eine neue Ära für die graphenbasierte Datenverarbeitung
In einem Zeitalter immer komplexer und verknüpfterer Daten ist es wichtig, die Grenzen der Stringverarbeitung im Hinblick auf moderne Herausforderungen wie soziale Netzwerke und Pangenomik zu definieren, die einen Übergang zu markierten Graphen erfordern. Mit Unterstützung durch das Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmenprogramm möchte Projekt SURE eine vielseitige neue Datenstruktur schaffen, indem Suffixbäume (die nicht mehr der Goldstandard für lineare Strings sind) auf Automaten und Graphen erweitert werden. Dieser Ansatz, der Algorithmen, Datenkomprimierung und Bioinformatik miteinander verbindet, ist entscheidend für die Handhabung vielfältiger Genomdaten ohne Verzerrung durch ein einzelnes Referenzgenom. Das Projekt etabliert zudem ein neues Paradigma für die Untersuchung regulärer Sprachen, um den Weg für eine effizientere Datenanalyse zu ebnen.
Ziel
The SURE project (SUffix trees meet REgular languages) is an interdisciplinary project at the intersection of several areas: Algorithms, Data Compression, Automata Theory and Bioinformatics. Its primary objective is to extend the suffix tree, the most important data structure for string processing, to labeled graphs and automata, and to use this new paradigm for studying regular languages.
The suffix tree of a string supports a myriad of natural queries on strings, including multiple pattern matching variants. Suffix trees inspired a variety of related data structures for string algorithms, such as the suffix array, the Burrows-Wheeler transform and the FM-index.
Today’s world demands the processing and analysis of increasingly complex, interrelated data. All these relationships can be captured by using (labeled) graphs. For example, the World Wide Web can be modeled as a graph, where elements are connected through hyperlinks. Graphs are also widely used to model social networks and to create databases. The SURE project will lead to a new data structure, the suffix tree of a graph, efficiently supporting all previous queries on graphs. This will be crucial in the emerging field of pangenomics, where graphs can store multiple genomes, overcoming the inherent bias of a single reference genome.
Graphs provide a natural framework for analyzing regular languages in automata theory. Recent results indicate that several string-processing data structures suggest a new paradigm for analyzing regular languages. The SURE project will extend this paradigm through the suffix tree of a graph, proving that the same ideas can be applied to other formalisms (such as omega-regular languages). We will also show how to study the hierarchy of regular languages induced by these data structures through the lens of regular expressions and logic.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-GF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - Global Fellowships
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2025-PF
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
67100 L'Aquila
Italien
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.