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Elucidate TE Impact On Sex Chromosome Regulatory Evolution

Descrizione del progetto

Una nuova analisi del ruolo del «disordine genetico» nei cromosomi sessuali

Le differenze genetiche tra maschi e femmine in molte specie si riducono ai cromosomi sessuali che si sono evoluti in modo divergente nel corso di milioni di anni. Man mano che il cromosoma Y maschile si degrada, perde i geni codificanti le proteine, costringendo il cromosoma X femminile a lavorare di più per mantenere l’equilibrio tra i livelli proteici cellulari. È noto che il cromosoma Y accumuli un «disordine genetico» (elementi trasponibili) durante questo processo di degrado. Questo disordine è considerato una mutazione deleteria. Sostenuto dal programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto TESexReg esaminerà tre coppie di neo-cromosomi sessuali di formiche e grilli sottoposti a evoluzione regolatoria per cambiare questa prospettiva. L’équipe di ricerca tenterà di capire se questo disordine genetico svolga un ruolo attivo e utile, silenziando intenzionalmente i geni del cromosoma Y che stanno per morire. I risultati del progetto potrebbero spiegare come i cromosomi riscrivono le proprie regole di funzionamento.

Obiettivo

Understanding sex chromosome evolution is crucial in evolutionary biology. In eukaryotes with separate sexes, sex determination often involves heteromorphic sex chromosomes that have diverged after recombination arrest. The Y(/W) chromosome loses protein-coding genes over time, causing gene dosage imbalance between sexes and Dosage Compensation (DC) mechanisms' evolution. The first steps of DC evolution are still unclear. Recent theoretical work suggests a gradual coevolution of X(/Z)-upregulation and Y(/W)-downregulation through cis-regulators divergence. In agreement, positive selection on Y-cis regulators drives Y-downregulation in stickleback. Yet, while it loses genes, the Y(/W) chromosome also accumulates Transposable Elements (TEs). This accumulation is generally considered as a source of deleterious mutations contributing to Y(/W) degeneration, however it could also actively contribute to the silencing of Y-linked genes, as the silencing mechanisms controlling TEs proliferation can spread to nearby genes. So far, this dual role of TEs has not been fully appreciated. The proposed project will fill this knowledge gap by examining three pairs of ant-cricket neo-sex chromosomes undergoing regulatory evolution. I will assess TE dynamics, its impact on cis-regulators chromatin structure and gene expression, and especially if TEs actively silence Y-protein accumulating deleterious mutations. This project will use a multi-disciplinary approach that combines comparative genomics, transcriptomics, epigenetics, and population genetics and portray sex chromosome regulatory evolution with an unprecedented level of detail. I will acquire new skills in epigenetics, deepen my knowledge of theoretical population genetics, and improve my management and writing skills. In exchange, I will share my expertise in bioinformatics and TEs, as well as my knowledge of a promising new biological model, which will certainly spark new research ideas and collaborations.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

Parole chiave

Programma(i)

Argomento(i)

Meccanismo di finanziamento

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

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Invito a presentare proposte

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2025-PF

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Coordinatore

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
Contributo netto dell'UE
€ 226 420,56
Indirizzo
RUE MICHEL ANGE 3
75794 Paris
Francia
Regione
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale
Nessun dato