Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Elucidate TE Impact On Sex Chromosome Regulatory Evolution

Opis projektu

Ponowne spojrzenie na rolę „genetycznego bałaganu” w chromosomach płciowych

Różnice genetyczne między samcami a samicami wielu gatunków sprowadzają się do chromosomów płciowych, które uległy rozdzieleniu w ciągu milionów lat. W miarę degradacji męskiego chromosomu Y traci on geny kodujące białka, co zmusza żeński chromosom X do dodatkowej pracy, aby utrzymać równowagę poziomu białek komórkowych. Wiadomo, że podczas procesu rozkładu chromosom Y gromadzi „genetyczne śmieci” (elementy transpozycyjne). Ten „bałagan” jest postrzegany jako szkodliwe mutacje. Zespół projektu TESexReg, realizowanego przy wsparciu z działań „Maria Skłodowska-Curie”, zbada trzy pary nowych chromosomów płciowych u mrówek i świerszczy, które przechodzą ewolucję regulacyjną, co pozwoli zweryfikować ten punkt widzenia. Badacze ocenią, czy ten bałagan genetyczny odgrywa aktywną, pomocną rolę, celowo wyciszając umierające geny chromosomu Y. Wyniki projektu mogą ujawnić, w jaki sposób chromosomy przepisują własne zasady regulacyjne.

Cel

Understanding sex chromosome evolution is crucial in evolutionary biology. In eukaryotes with separate sexes, sex determination often involves heteromorphic sex chromosomes that have diverged after recombination arrest. The Y(/W) chromosome loses protein-coding genes over time, causing gene dosage imbalance between sexes and Dosage Compensation (DC) mechanisms' evolution. The first steps of DC evolution are still unclear. Recent theoretical work suggests a gradual coevolution of X(/Z)-upregulation and Y(/W)-downregulation through cis-regulators divergence. In agreement, positive selection on Y-cis regulators drives Y-downregulation in stickleback. Yet, while it loses genes, the Y(/W) chromosome also accumulates Transposable Elements (TEs). This accumulation is generally considered as a source of deleterious mutations contributing to Y(/W) degeneration, however it could also actively contribute to the silencing of Y-linked genes, as the silencing mechanisms controlling TEs proliferation can spread to nearby genes. So far, this dual role of TEs has not been fully appreciated. The proposed project will fill this knowledge gap by examining three pairs of ant-cricket neo-sex chromosomes undergoing regulatory evolution. I will assess TE dynamics, its impact on cis-regulators chromatin structure and gene expression, and especially if TEs actively silence Y-protein accumulating deleterious mutations. This project will use a multi-disciplinary approach that combines comparative genomics, transcriptomics, epigenetics, and population genetics and portray sex chromosome regulatory evolution with an unprecedented level of detail. I will acquire new skills in epigenetics, deepen my knowledge of theoretical population genetics, and improve my management and writing skills. In exchange, I will share my expertise in bioinformatics and TEs, as well as my knowledge of a promising new biological model, which will certainly spark new research ideas and collaborations.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2025-PF

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
Wkład UE netto
€ 226 420,56
Koszt całkowity
Brak danych