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Gut Commensals as Next-Generation Chassis for Natural Product Therapeutics

Descrizione del progetto

Programmare i batteri intestinali per la somministrazione di farmaci

Il microbiota intestinale umano svolge un ruolo fondamentale nella digestione, nell’immunità, nel metabolismo e nella salute generale. Gli scienziati stanno esplorando sempre più metodi per modificare geneticamente i batteri intestinali benefici in modo che possano produrre farmaci direttamente all’interno del corpo con minori effetti collaterali; ciononostante, le attuali terapie microbiche spesso utilizzano batteri che non si integrano in maniera efficace nell’intestino e mettono in mostra un potenziale limitato nella produzione di farmaci. Sostenuto dal programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto GUT-NAT si propone di sviluppare una nuova piattaforma terapeutica basata sul Clostridium leptum, un batterio intestinale comune e stabile: i ricercatori programmeranno questo ceppo per produrre composti naturali, inclusi potenziali agenti antitumorali, aprendo nuove possibilità per lo sviluppo di trattamenti basati sul microbioma.

Obiettivo

Recent advances in synthetic biology and microbiome research have highlighted the pivotal role of the human gut microbiome not only in maintaining gastrointestinal health but also in regulating systemic processes such as metabolism, immunity, and neurobiology. In this context, engineering commensal bacteria for precise, localized therapeutic delivery with minimal side effects is an emerging frontier. To date, most engineered microbial therapeutics have focused on probiotic species such as Escherichia coli or Lactobacillus spp.—due to their genetic tractability. However, these species often struggle to engraft durably in the complex gut environment. Moreover, commensal strains developed so far have been limited to heterologous production of protein-based therapeutics. To broaden the therapeutic arsenal, GUT-NAT aims to develop Clostridium leptum, a prevalent human gut commensal, into a next-generation, genetically programmable chassis for the biosynthesis of clinically relevant and functionally diverse therapeutic natural products. My preliminary results demonstrated successful genetic manipulation of C. leptum. GUT-NAT’s goals will be achieved through three integrated objectives, leveraging my expertise in microbial genetic engineering, natural product biosynthesis, and analytical chemistry: (1) characterization of genetic regulatory elements in C. leptum. (2) metabolic engineering, and (3) biosynthesis of anticancer natural products in C. leptum using state-of-the-art tools such as PacBio long-read genome sequencing, high-efficiency inducible CRISPR-based genome editing, and advanced mass spectrometry. Together, these efforts will (i) unlock the synthetic potential of an underexplored gut commensal, (ii) establish a robust and persistently engrafted chassis for the production of natural product therapeutics, and (iii) accelerate the discovery of novel bioactive metabolites from anaerobic microbiota, thus addressing a critical gap in microbiome synthetic biology.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

Parole chiave

Programma(i)

Argomento(i)

Meccanismo di finanziamento

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

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Invito a presentare proposte

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2025-PF

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Coordinatore

VIB VZW
Contributo netto dell'UE
€ 200 400,00
Indirizzo
SUZANNE TASSIERSTRAAT 1
9052 ZWIJNAARDE - GENT
Belgio
Regione
Vlaams Gewest Prov. Oost-Vlaanderen Arr. Gent
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale
Nessun dato