Description du projet
Cadre prédictif et protocole d’extraction sur mesure ciblant l’ADN ancien sédimentaire
L’ADN ancien conservé dans les sédiments offre un aperçu remarquable des écosystèmes, des migrations et des évolutions du passé. Son extraction est toutefois coûteuse et peu fiable, alors que seule une fraction des sédiments échantillonnés fournissent du matériel génétique exploitable. Un facteur essentiel souvent négligé est le rôle des minéraux argileux dans la fixation et la conservation de l’ADN. Soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet CASANDRA vise à étudier cette question à l’aide d’approches minéralogiques, géochimiques et géoarchéologiques. Ses résultats serviront de base à un cadre prédictif permettant de cibler les échantillons riches en ADN, associé à un protocole d’extraction sur mesure, afin de réduire les coûts et d’accroître l’efficacité. Ces avancées nous aideront également à mieux comprendre comment les écosystèmes ont réagi aux changements climatiques passés, ce qui pourrait améliorer les mesures prises face aux changements futurs.
Objectif
Unlocking Earth’s history depends on a reliable interpretation of the remnants of the past that can withstand degradation. Sedimentary ancient DNA (sedaDNA) offers a unique genetic archive of paleoorganisms enabling reconstruction of paleoenvironments, paleomigrations and evolutionary change. However, sedaDNA recovery is expensive and inefficient only a small fraction of sediments yield usable DNA, and current protocols overlook the mineral controls that govern its preservation. CASANDRA will transform this bottleneck by investigating how clay minerals, and particularly smectites, bind and preserve DNA in reworked cave sediments. By integrating mineralogic, geochemical and geoarchaeological approaches, CASANDRA will link sedaDNA adsorption to depositional histories, enabling us to predict where sedaDNA survives within the micromorphologic context of cave sediments. These insights will then inform the development of a new DNA extraction protocol, specifically tailored to the geochemical conditions of cave deposits. Field material from caves in Croatia, Spain and Greece will be analysed using state-of-the-art facilities at ISTerre Grenoble under the supervision of a leading expert in mineral–DNA interactions, in close collaboration with evolutionary anthropologists in Vienna to ensure contextual accuracy and cross-disciplinary uptake. The project will deliver: a) a predictive framework to target sedaDNA-rich samples based on mineralogy and site depositional history, reducing costly trial and error sampling, and b) a tailored extraction protocol optimised for clay-bound DNA, delivering higher yields and cleaner libraries for sequencing. These innovations will cut costs, increase efficiency, and expand the reach of sedaDNA studies. Beyond methodological advances, CASANDRA will contribute to a deeper understanding into ecosystem responses to past climate shifts enhancing our ability to anticipate future shifts in a rapidly changing environment.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2025-PF
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
75794 PARIS
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.