Projektbeschreibung
Vorhersagemodell und maßgeschneidertes Extraktionsprotokoll für sedimentäre alte DNA
In Sedimenten erhaltene uralte DNA bietet einen bemerkenswerten Einblick in vergangene Ökosysteme, Wanderungen und evolutionäre Veränderungen – doch die Gewinnung ist kostspielig und unzuverlässig, da nur ein Bruchteil der untersuchten Sedimente brauchbares genetisches Material liefert. Ein wichtiger, oft übersehener Faktor ist die Rolle, die Tonmineralien bei der Bindung und Konservierung von DNA einnehmen. Unterstützt über die Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen zielt das Projekt CASANDRA darauf ab, dies mithilfe mineralogischer, geochemischer und geoarchäologischer Ansätze zu untersuchen. Die Ergebnisse bilden die Grundlage für ein Vorhersagemodell zur gezielten Analyse von DNA-reichen Proben sowie für ein maßgeschneidertes Extraktionsprotokoll, wodurch Kosten gesenkt und die Effizienz gesteigert werden. Diese Fortschritte werden auch das Verständnis dafür vertiefen, wie Ökosysteme auf vergangene Klimaveränderungen reagierten, und die Reaktionen auf zukünftige Veränderungen möglicherweise verbessern.
Ziel
Unlocking Earth’s history depends on a reliable interpretation of the remnants of the past that can withstand degradation. Sedimentary ancient DNA (sedaDNA) offers a unique genetic archive of paleoorganisms enabling reconstruction of paleoenvironments, paleomigrations and evolutionary change. However, sedaDNA recovery is expensive and inefficient only a small fraction of sediments yield usable DNA, and current protocols overlook the mineral controls that govern its preservation. CASANDRA will transform this bottleneck by investigating how clay minerals, and particularly smectites, bind and preserve DNA in reworked cave sediments. By integrating mineralogic, geochemical and geoarchaeological approaches, CASANDRA will link sedaDNA adsorption to depositional histories, enabling us to predict where sedaDNA survives within the micromorphologic context of cave sediments. These insights will then inform the development of a new DNA extraction protocol, specifically tailored to the geochemical conditions of cave deposits. Field material from caves in Croatia, Spain and Greece will be analysed using state-of-the-art facilities at ISTerre Grenoble under the supervision of a leading expert in mineral–DNA interactions, in close collaboration with evolutionary anthropologists in Vienna to ensure contextual accuracy and cross-disciplinary uptake. The project will deliver: a) a predictive framework to target sedaDNA-rich samples based on mineralogy and site depositional history, reducing costly trial and error sampling, and b) a tailored extraction protocol optimised for clay-bound DNA, delivering higher yields and cleaner libraries for sequencing. These innovations will cut costs, increase efficiency, and expand the reach of sedaDNA studies. Beyond methodological advances, CASANDRA will contribute to a deeper understanding into ecosystem responses to past climate shifts enhancing our ability to anticipate future shifts in a rapidly changing environment.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2025-PF
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
75794 PARIS
Frankreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.