Opis projektu
Model prognostyczny i dostosowany protokół ekstrahowania ukierunkowany na starożytne DNA z osadów
Starożytne DNA zachowane w osadach stanowi niezwykłe źródło informacji o dawnych ekosystemach, migracjach i zmianach ewolucyjnych – jednak jego pozyskiwanie jest kosztowne i niepewne, a tylko niewielka część pobranych próbek osadów dostarcza materiału genetycznego nadającego się do wykorzystania. Kluczowym, często pomijanym czynnikiem jest rola minerałów ilastych w wiązaniu i zachowaniu DNA. Projekt CASANDRA, korzystający ze wsparcia programu działania „Maria Skłodowska-Curie”, zbada go za pomocą metod mineralogicznych, geochemicznych i geoarcheologicznych. Wyniki tych badań posłużą jako podstawa do opracowania modelu prognostycznego umożliwiającego selekcję próbek bogatych w DNA oraz dostosowanego protokołu ekstrahowania, co pozwoli obniżyć koszty i zwiększyć wydajność. Postępy te pozwolą również lepiej zrozumieć, w jaki sposób ekosystemy reagowały na przeszłe zmiany klimatu, co potencjalnie przyczyni się do skuteczniejszego reagowania na przyszłe.
Cel
Unlocking Earth’s history depends on a reliable interpretation of the remnants of the past that can withstand degradation. Sedimentary ancient DNA (sedaDNA) offers a unique genetic archive of paleoorganisms enabling reconstruction of paleoenvironments, paleomigrations and evolutionary change. However, sedaDNA recovery is expensive and inefficient only a small fraction of sediments yield usable DNA, and current protocols overlook the mineral controls that govern its preservation. CASANDRA will transform this bottleneck by investigating how clay minerals, and particularly smectites, bind and preserve DNA in reworked cave sediments. By integrating mineralogic, geochemical and geoarchaeological approaches, CASANDRA will link sedaDNA adsorption to depositional histories, enabling us to predict where sedaDNA survives within the micromorphologic context of cave sediments. These insights will then inform the development of a new DNA extraction protocol, specifically tailored to the geochemical conditions of cave deposits. Field material from caves in Croatia, Spain and Greece will be analysed using state-of-the-art facilities at ISTerre Grenoble under the supervision of a leading expert in mineral–DNA interactions, in close collaboration with evolutionary anthropologists in Vienna to ensure contextual accuracy and cross-disciplinary uptake. The project will deliver: a) a predictive framework to target sedaDNA-rich samples based on mineralogy and site depositional history, reducing costly trial and error sampling, and b) a tailored extraction protocol optimised for clay-bound DNA, delivering higher yields and cleaner libraries for sequencing. These innovations will cut costs, increase efficiency, and expand the reach of sedaDNA studies. Beyond methodological advances, CASANDRA will contribute to a deeper understanding into ecosystem responses to past climate shifts enhancing our ability to anticipate future shifts in a rapidly changing environment.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2025-PF
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
75794 PARIS
Francja
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.