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Coarse-grained modelling of RNA phase transitions in multicomponent biomolecular condensates

Ziel

Biomolecular condensates of proteins and nucleic acids are crucial for cellular organization, enabling adaptable compartmentalization without a membrane. Liquid-like condensates allow dynamic molecular exchange, whereas pathological solidification disrupts their function, leading to kinetically trapped states linked to neurodegenerative diseases. Although protein condensation has been extensively studied, how RNA sequence, structure, and concentration govern condensate stability and drive pathological solidification remains as a key open question. My project aims to advance the state-of-the-art by designing the first residue-level coarse-grained RNA model to explore RNA and RNA–protein condensates integrated with established protein models. By including canonical and non-canonical base-pairing as well as key tertiary interactions such as G-quadruplexes, my model will enable simulations of RNA–protein condensates with unprecedented resolution and physicochemical realism. The project will achieve three key goals: (1) identify the molecular grammar of RNA–RNA and RNA–protein condensates by mapping the nucleotide and nucleotide–amino acid interactions behind phase-separation via all-atom simulations; (2) develop a sequence-resolved RNA model compatible with residue-resolution protein models to describe RNA-driven phase behaviour of multicomponent condensates as well as their potential aberrant liquid-to-solid transitions; and (3) perform the first high-resolution simulation of stress granules containing multiple proteins and RNAs to resolve their complex interaction motifs, multivalent binding networks, and spatial organization controlling their stability and molecular architecture. By providing a predictive framework for multicomponent condensates, this work will lay the foundation for understanding the sequence-encoded principles of RNA–protein assemblies and their dysfunction in disease, advancing fundamental biological knowledge and informing therapeutic innovation.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2025-PF

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

UNIVERSIDAD COMPLUTENSE DE MADRID
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 209 914,56
Adresse
AVENIDA DE SENECA 2
28040 MADRID
Spanien

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Region
Comunidad de Madrid Comunidad de Madrid Madrid
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten
Mein Booklet 0 0