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Coarse-grained modelling of RNA phase transitions in multicomponent biomolecular condensates

Obiettivo

Biomolecular condensates of proteins and nucleic acids are crucial for cellular organization, enabling adaptable compartmentalization without a membrane. Liquid-like condensates allow dynamic molecular exchange, whereas pathological solidification disrupts their function, leading to kinetically trapped states linked to neurodegenerative diseases. Although protein condensation has been extensively studied, how RNA sequence, structure, and concentration govern condensate stability and drive pathological solidification remains as a key open question. My project aims to advance the state-of-the-art by designing the first residue-level coarse-grained RNA model to explore RNA and RNA–protein condensates integrated with established protein models. By including canonical and non-canonical base-pairing as well as key tertiary interactions such as G-quadruplexes, my model will enable simulations of RNA–protein condensates with unprecedented resolution and physicochemical realism. The project will achieve three key goals: (1) identify the molecular grammar of RNA–RNA and RNA–protein condensates by mapping the nucleotide and nucleotide–amino acid interactions behind phase-separation via all-atom simulations; (2) develop a sequence-resolved RNA model compatible with residue-resolution protein models to describe RNA-driven phase behaviour of multicomponent condensates as well as their potential aberrant liquid-to-solid transitions; and (3) perform the first high-resolution simulation of stress granules containing multiple proteins and RNAs to resolve their complex interaction motifs, multivalent binding networks, and spatial organization controlling their stability and molecular architecture. By providing a predictive framework for multicomponent condensates, this work will lay the foundation for understanding the sequence-encoded principles of RNA–protein assemblies and their dysfunction in disease, advancing fundamental biological knowledge and informing therapeutic innovation.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2025-PF

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

UNIVERSIDAD COMPLUTENSE DE MADRID
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 209 914,56
Indirizzo
AVENIDA DE SENECA 2
28040 MADRID
Spagna

Mostra sulla mappa

Regione
Comunidad de Madrid Comunidad de Madrid Madrid
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato
Il mio fascicolo 0 0