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Identification of long non-coding RNA-based biomarkers of immunotherapy response in Triple-Negative Breast Cancer via liquid biopsy profiling

Description du projet

L’utilisation de biomarqueurs ARN pour prédire la réponse à l’immunothérapie dans le cancer du sein

Le cancer du sein triple négatif ne présente pas les cibles moléculaires exploitées par les traitements standard, ce qui en fait le sous-type de cancer du sein le plus difficile à traiter. Les inhibiteurs de points de contrôle immunitaires se sont révélés prometteurs, mais les taux de réponse varient considérablement, et il n’existe pas de biomarqueurs prédictifs fiables. Les ARN non codants longs constituent une classe de molécules régulatrices qui influencent les voies immunitaires et qui se sont révélés être des indicateurs potentiels de la sensibilité à l’immunothérapie. Soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet Triple-R vise à identifier et à caractériser des biomarqueurs d’ARN non codants longs afin de prédire la réponse à l’immunothérapie dans le cancer du sein triple négatif. Les chercheurs analyseront des tissus tumoraux et des biopsies liquides afin de mettre en évidence des signatures d’ARN liées à la sensibilité au traitement. Les résultats du projet devraient permettre de faire progresser les stratégies d’oncologie de précision pour ce sous-type de cancer agressif.

Objectif

Triple-negative breast cancer (TNBC) is the most aggressive and lethal subtype of breast cancer, characterized by the absence of estrogen receptor, progesterone receptor and HER2 expression. This lack of molecular targets limits treatment options and highlights the urgent need of novel therapeutic strategies. While immune checkpoint inhibitors (ICIs) targeting the PD-1/PD-L1 axis have shown promise in early-stage TNBC, response rates remain variable and difficult to predict. Recent studies have implicated long non-coding RNAs (lncRNAs) as key regulators of immune-related pathways, suggesting their potential as modulators of immunotherapy sensitivity.

The Triple-R project aims to identify and functionally characterize lncRNA-based biomarkers predictive of response to neoadjuvant immunotherapy in early TNBC. The specific objectives to achieved this are: 1) To compare lncRNA expression profiles, integrating RNA-sequencing data from tumour tissue and liquid biopsy samples —including exosomes, circulating tumour cells and cell-free RNA— collected from patients undergoing treatment. 2) To infer lncRNA expression from cell-free DNA fragmentomics. 3) To characterize the functional role of selected lncRNAs through CRISPR-based knockdown or overexpression in selected TNBC cell lines under ICIs treatment, assessing the impact on cell proliferation and relative fitness. Furthermore, the project will benefit from an international collaboration (Peter MacCallum Cancer Centre, Australia), with complementary results from the BCT 1702-CHARIOT clinical trial that will enhance the robustness and translational relevance of the findings.

The proposal introduces innovative approaches to advance precision oncology, focusing on gene expression profiling via liquid biopsy. By identifying novel potential biomarkers and lncRNA signatures linked to immunotherapy sensitivity, it aims to improve patient stratification and enable more effective, personalized treatment strategies for TNBC.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

Mots‑clés

Programme(s)

Thème(s)

Régime de financement

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

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Appel à propositions

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2025-PF

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Coordinateur

FUNDACION PARA LA INVESTIGACION DE MALAGA EN BIOMEDICINA Y SALUD
Contribution nette de l'UE
€ 209 914,56
Adresse
CALLE SEVERO OCHOA 35, PARQUE TECNOLOGICO DE ANDALUCIA
29590 MALAGA
Espagne
Région
Sur Andalucía Málaga
Type d’activité
Research Organisations
Liens
Coût total
Aucune donnée